[发明专利]体外用细胞代谢轮廓筛选马兜铃酸致肾毒性标志物的方法在审

专利信息
申请号: 201410648382.9 申请日: 2014-11-14
公开(公告)号: CN105651868A 公开(公告)日: 2016-06-08
发明(设计)人: 肖红斌;刘晓燕;程孟春;王莉 申请(专利权)人: 中国科学院大连化学物理研究所
主分类号: G01N30/02 分类号: G01N30/02
代理公司: 沈阳科苑专利商标代理有限公司 21002 代理人: 马驰
地址: 116023 *** 国省代码: 辽宁;21
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摘要:
搜索关键词: 体外 细胞 代谢 轮廓 筛选 马兜铃 酸致肾 毒性 标志 方法
【权利要求书】:

1.一种体外用细胞代谢轮廓筛选马兜铃酸致肾毒性标志物的方 法,其特征在于:应用代谢组学方法研究体外细胞损伤模型中代谢物 差异;

包括以下步骤:

(1)确定马兜铃酸致肾细胞明显损伤的有效剂量;

(2)对正常肾细胞、马兜铃酸药物损伤肾细胞的胞内代谢物进行 分析得到胞内代谢轮廓;

(3)应用多变量统计方法分析正常细胞和马兜铃酸药物损伤细胞 的代谢轮廓数据,结合代谢物随药物作用时间的变化规律,筛选标志 物。

2.根据权利要求1所述方法,其特征在于:步骤(1)使用3-(4, 5-二甲基噻唑-2)-2,5-二苯基四氮唑溴盐(MTT)染色法确定马兜 铃酸致肾细胞明显损伤的有效剂量,细胞明显损伤指同等培养条件下 马兜铃酸诱导损伤实验组细胞数目与正常组细胞数目相比,具有显著 性差异,P<0.5,能够导致这种明显损伤的马兜铃酸剂量即为马兜铃 酸致肾细胞明显损伤的有效剂量。

3.根据权利要求1所述方法,其特征在于:步骤(2)所述正常肾 细胞为人源化正常肾细胞HL7702;所述马兜铃酸药物损伤肾细胞为 采用马兜铃酸致肾细胞明显损伤的有效剂量诱导损伤的人源化正常 肾细胞HL7702,诱导损伤时间为6-24h。

4.根据权利要求1所述方法,其特征在于:步骤(2)使用超高 效液相色谱-质谱联用技术对胞内代谢物进行分析。

5.根据权利要求1或4所述方法,其特征在于:步骤(2)所述 得到胞内代谢轮廓的过程中,采用一套细胞样本采集和处理的规范化 流程来采集、处理细胞,该流程的步骤为:

细胞刮刮取正常细胞、诱导作用时间为24h以及在0-24h中间两 个时间点的(n×4)个细胞样品分别置于离心管中,离心得细胞饼即 为所需细胞样品(每个细胞样品约10-100mg);细胞样品重悬于 1-1.5ml甲醇的水溶液(甲醇/水,v/v,4/1-2/1),用超声细胞破碎仪 冰上裂解细胞,得到的细胞裂解液0-4℃离心,上清液冻干复溶于 100-300ul体积分数为1/4-3/4的甲醇溶液中,得n×4个样本;对n ×4个样本依次进行超高效液相色谱-质谱联用技术分析,最终得到n ×4个样本的总离子流图,即为肾细胞内代谢轮廓谱;

其中n为每组平行试验的数量,为大于或等于6的正整数。

6.根据权利要求5所述方法,其特征在于:超高效液相色谱-质谱 联用技术中,色谱柱为C18柱,流动相采用体积分数为0.1%-0.2%甲酸 水溶液(A相)和乙腈(B相),梯度洗脱,质谱采用ESI正离子模 式检测。

7.根据权利要求5所述的细胞样本采集和处理的规范化流程,其 特征在于;取细胞裂解液10-20μL,采用蛋白定量试剂盒进行总蛋 白定量,给药组与对照组样品的蛋白总量相除得出总蛋白差异系数, 给药组各色谱峰面积除以此系数将给药组细胞数目校正到对照组的 细胞数目,即可校正由于细胞数目的微小差异所造成的代谢谱强度的 差异。

8.根据权利要求1所述方法,其特征在于:步骤(3)所述多变 量统计方法为偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)方法;

具体步骤为:采用R语言对样本的胞内代谢轮廓谱进行峰提取, 峰匹配,生成一个数据矩阵,数据矩阵采用偏最小二乘法-判别分析 (PLS-DA)方法进行多元统计分析,对肾细胞不同损伤程度的代谢 谱数据进行建模,根据模型中变量重要性因子筛选大于或等于1.5的 检测离子;结合这些离子在肾损伤进展过程中变化规律,进一步筛选 呈单一性变化(升高或者下降)的离子,可被认为是在马兜铃酸致肾 损伤过程中的潜在标志物。

9.根据权利要求1所述方法,其特征在于:步骤(3)最后要对 筛选出的潜在标志物进行验证,采用感受曲线(ROC)下面积值(AUC) 对其预测准确度进行评估,AUC通常在0.5到1之间,AUC>0.5的 情况下,AUC越接近1,说明预测准确度越好,AUC<0.5不符合真 实情况;然后对筛选出的标志物进行结构鉴定。

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