[发明专利]稻瘟病菌无毒基因AvrPib特异性分子标记及其方法与应用有效
申请号: | 201410570496.6 | 申请日: | 2014-10-23 |
公开(公告)号: | CN104328114A | 公开(公告)日: | 2015-02-04 |
发明(设计)人: | 潘庆华;张树林;何丽云;杨先锋;王玲 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 林丽明 |
地址: | 510642 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 稻瘟病 无毒 基因 avrpib 特异性 分子 标记 及其 方法 应用 | ||
1.稻瘟病菌无毒基因AvrPib的分子标记,其特征在于,所述分子标记由引物对AvrPibF1/R1和AvrPibF2/R2组成,所述引物对的序列如SEQ ID NO:1~4所示。
2.权利要求1所述分子标记在稻瘟病菌群体监测中的应用。
3.应用权利要求1所述分子标记鉴定稻瘟病菌基因型的方法,其特征在于,通过常规PCR技术,利用所述引物对分别对待测稻瘟病菌株进行基于PCR扩增产物的基因型分型。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,测试菌株的最终基因型由权利要求1所述的2对分子标记PCR基因型分析整合获得。
5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述PCR的扩增体系为20 μl,包括2 μl 10×PCR Buffer、1.6 μl 2.5 mM的dNTPs、0.1 μl 5 U/μl的rTaq酶、1 μl 90 ng/μl的DNA模板、10 μM引物各1μl,余量为双蒸水。
6.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,当利用引物对AvrPibF1/R1进行扩增时,PCR扩增条件为:预变性94℃ 3 min,变性94℃ 30 sec,退火62℃ 30 sec,延伸72℃ 3 min 20 sec,扩增35个循环,最后72℃延伸5 min。
7.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,当利用引物对AvrPibF2/R2进行扩增时,PCR扩增条件为:预变性94℃ 3 min,变性94℃ 30 sec,退火60℃ 30 sec,延伸72℃ 2 min 20 sec,扩增35个循环,最后72℃延伸5 min。
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