[发明专利]植物叶片总RNA提取方法有效
申请号: | 201410444486.8 | 申请日: | 2014-09-03 |
公开(公告)号: | CN104263720B | 公开(公告)日: | 2019-07-12 |
发明(设计)人: | 王华芳;唐文思;吴国栋 | 申请(专利权)人: | 北京林业大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 中科专利商标代理有限责任公司 11021 | 代理人: | 吴小明 |
地址: | 100083 北京市*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 植物 叶片 rna 提取 方法 | ||
本发明属于分子生物学领域,特别涉及一种富含多糖多酚的植物叶片总RNA提取方法。植物材料经液氮研磨后,经连续两次裂解,水饱和酚与氯仿混合溶液抽提,异丙醇沉淀得到总RNA。本发明的有益效果在于:1、连续两次裂解,有效克服多糖、多酚、次生代谢物对RNA提取过程的影响,2、无需水浴,减少RNase污染,3、无需使用低温离心机,操作方便,4、本方法有效避免传统沉淀方法中LiCl残留对下游实验的影响,所提取的RNA可以满足反转录PCR和实时荧光定量PCR等后续分子生物学实验。
技术领域
本发明属于分子生物学领域,特别涉及一种富含多糖多酚的植物叶片总RNA提取的方法。
背景技术
从植物组织中提取高质量的总RNA对于基因克隆及其功能鉴定、基因的表达和调控分析、分子标记辅助育种等具有重要意义[1]。
从植物组织中提取高质量的总RNA存在困难。植物体内富含多糖多酚,在RNA提取过程中,细胞破碎后多糖多酚物质与RNA发生作用。酚类化合物极易被氧化,生成物(如醌类)能与RNA不可逆地结合,导致RNA活性丧失,用苯酚、氯仿抽提时RNA丢失[2],从而影响RNA的分离纯化;多糖会形成难溶的胶状物,与RNA共沉淀下来[3];多糖还可以抑制很多酶的活性,因此污染了多糖多酚的RNA无法用于进一步的分子生物学研究;RNase会造成RNA的化学降解和酶解,RNA提取过程中污染的RNA酶有两种来源:外源性RNA酶和内源性RNA酶。外源性RNA酶来自RNA制备过程中使用的玻璃、塑料制品和试剂及操作人员本身等,而内源性RNA酶是组织本身所固有的,当细胞破碎后即释放出来。因此,能否有效去除多糖、酚类化合物及去除或抑制RNA酶活性是提取高质量RNA成败的关键[4]。
现成的提取植物材料总RNA的方法对除多糖、酚类化合物及去除或抑制 RNA酶活性等亟需改良。目前,常见植物材料总RNA的方法主要有SDS法、CTAB法、异硫氰酸胍法[5]、热硼酸法[6]、商业化试剂盒Trizol[7]等,但对于多糖、多酚、次生代谢物较多的植物组织RNA的提取效果并不理想,阻碍了其分子生物学方面研究的进展[8]。我们迫切需要一种成本低廉,操作简单、方便,就能彻底除去材料中的蛋白质、DNA、多糖、多酚等有机类物质的提取方法。
发明内容
本发明目的是为了解决现有RNA提取方法对多糖、多酚、次生代谢物较多的植物组织RNA提取效果较差的缺陷,提供一种能彻底除去植物材料中蛋白质、DNA、多糖、多酚、以及次生代谢产物等有机类物质的总RNA提取方法。本方法所提取的RNA可满足反转录PCR和实时荧光定量PCR等研究的需要,同时大大降低实验的成本。
本发明为解决上述问题,提供一种新的植物叶片总RNA提取方法,其包括以下步骤:
(1)植物叶片在液氮环境下研磨成细粉状,快速转移到含有细胞裂解液I的离心管中,混匀后加入盐-醇溶液混匀后离心;
(2)转移上清液到含有细胞裂解液II的离心管中,混匀后加入盐-醇溶液混匀后离心;
(3)转移上清液到新离心管中,经等体积的水饱和酚与氯仿组成的混合试剂抽提后离心;
(4)取上清液,加入异丙醇沉淀离心,加DEPC水(灭菌过的0.1%DEPC水简称DEPC水))溶解总核酸,再用DNA酶I溶液消化DNA;
(5)经等体积氯仿抽提离心;
(6)转上清液到新的离心管,加入异丙醇沉淀离心;
(7)用醇洗涤,再经空气干燥后,溶解在DEPC水中低温保存。
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