[发明专利]一种特异性结合甲胎蛋白核酸适配体的筛选方法有效
申请号: | 201410390057.7 | 申请日: | 2014-08-11 |
公开(公告)号: | CN104131105A | 公开(公告)日: | 2014-11-05 |
发明(设计)人: | 吴伟忠;胡洪卫;郭玮;冬黎黎;谈绮文 | 申请(专利权)人: | 复旦大学附属中山医院;上海艾津生物医药科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海卓阳知识产权代理事务所(普通合伙) 31262 | 代理人: | 金重庆 |
地址: | 200032 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 特异性 结合 蛋白 核酸 适配体 筛选 方法 | ||
1.一种特异性结合甲胎蛋白核酸适配体的筛选方法,其特征在于,所述的筛选方法包括以下步骤:设计并构建大容量随机寡核苷酸文库以及用于PCR扩增的上游引物和下游引物,通过以毛细管电泳为基础的SELEX方法,富集能与甲胎蛋白结合的寡核苷酸,最终经克隆、测序以及验证后得到与甲胎蛋白特异性结合的寡核苷酸,即适配体。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的随机寡核苷酸文库以及上、下游引物序列为:
核苷酸文库的序列如SEQ ID NO.1所示;
物的序列如SEQ ID NO.2所示;
物的序列如SEQ ID NO.3所示。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的以毛细管电泳为基础的SELEX方法包括以下步骤:随机寡核苷酸文库与甲胎蛋白共同孵育,混合物进行毛细管电泳,收集与甲胎蛋白结合的寡核苷酸,常规PCR扩增,制备单链DNA文库,文库纯化后用于下一轮筛选。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述常规PCR条件为:94 ℃,3 min;94 ℃,30 s,58 ℃,30 s,72 ℃,30 s,扩增10个循环;72 ℃,5 min。
5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述单链DNA文库制备方法包括以下步骤:在链霉亲和素偶联的磁珠中加入常规PCR扩增产物,常温孵育,通过双链DNA上的生物素与磁珠上的链霉亲和素的相互作用将双链DNA吸附到磁珠表面,洗涤磁珠后加入碱液,常温变性,含有单链DNA的上清液用弱酸中和,产物PAGE切胶纯化。
6.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述的SELEX筛选的次数为4次。
7.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述的磁珠与PCR产物的孵育时间控制在20-30 min,碱变性时间控制在5-10 min。
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