[发明专利]一种重组毕赤酵母工程菌和代谢的重组木聚糖酶及其制备在审
申请号: | 201410383350.0 | 申请日: | 2014-08-07 |
公开(公告)号: | CN104130951A | 公开(公告)日: | 2014-11-05 |
发明(设计)人: | 陈勇;张慧玲;李晓 | 申请(专利权)人: | 新疆农业大学;陈勇 |
主分类号: | C12N1/15 | 分类号: | C12N1/15;C12N15/56;C12N15/81;C12N9/42;C12P19/14;C12R1/84 |
代理公司: | 无 | 代理人: | 无 |
地址: | 830011 新疆维吾尔*** | 国省代码: | 新疆;65 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 重组 酵母 工程 代谢 聚糖 及其 制备 | ||
1.一种高表达木聚糖酶的基因工程菌GS115/pPIC9K-Xyn11Bm,该基因工程菌GS115/pPIC9K-Xyn11Bm菌种保藏编号为巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)CGMCC No. 9398。
2.一种如权利要求1所述高表达木聚糖酶的基因工程菌GS115/pPIC9K-Xyn11Bm的基因序列,其特征在于,所述基因序列是一种源于人工合成编码的瘤胃厌氧真菌Neocallimastix frontalis木聚糖酶基因Xyn11B优化的核苷酸序列Xyn11Bm,长度为1014bp,序列如SEQ ID NO:1所示。
3.一种能在毕赤酵母中高效表达的产木聚糖酶基因序列SEQ ID NO:1,此序列是在SEQ ID NO:2序列基础上定点诱变而成,所编码的氨基酸密码子可以在巴斯德毕赤酵母中有效表达,该人工合成的DNA共编码337个氨基酸残基,氨基酸残基排列顺序如SEQ ID No.3 所示。
4.根据权利要求2所述优化的Neocallimastix frontalis木聚糖酶基因Xyn11Bm的重组载体,其特征在于,所述重组载体为pPIC9K-Xyn11Bm。
5.一种优化的Neocallimastix frontalis木聚糖酶的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)根据酵母密码子偏爱性对Xyn11B的密码子进行初步替换;
(2)采用Oligo 6.0分析替换后基因序列中的限制性内切酶切割位点,通过密码子调整,消除基因序列中的Bgl II、Sac I、Sal I、EcoR I和Not I的切割位点;
(3)采用BioEdit 7.0分析调整后基因序列中mRNA隐蔽剪接位点,并再次对密码子进行调整,以消除其中的隐蔽剪接位点GGTAAG、GGTGAT、AATAAA、ATTTA、PolyT和PolyA,并计算GC百分比,再根据GC百分比对密码子最进一步调整,使其处于40-50%之间;
(4)采用RNA Structure 3.2对mRNA二级结构的自由能进行分析,筛选获得自由能最低的基因序列SEQ ID No. 1,并命名为Xyn11Bm;
(5)采用全基因合成方法获得SEQ ID No. 1所示核苷酸序列;
(6)构建含有SEQ ID No. 1所示核苷酸序列的重组载体pPIC9K-Xyn11Bm;
(7)将重组载体pPIC9K-Xyn11Bm转化宿主细胞GS115,获得重组菌株并在酵母细胞中表达;
(8)纯化所表达的木聚糖酶。
6.一种如权利要求5所述获得Neocallimastix frontalis木聚糖酶。
7.权利要求5 所述优化的Neocallimastix frontalis木聚糖酶用于非治疗目的降解木聚糖的应用。
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