[发明专利]一种通用型检测血小板细菌污染的荧光定量PCR方法在审

专利信息
申请号: 201410363658.9 申请日: 2014-07-29
公开(公告)号: CN104372072A 公开(公告)日: 2015-02-25
发明(设计)人: 蒙青林;李勇;田晶晶;魏双施;王红梅;段生宝;丁少华;陈晔洲;李冬 申请(专利权)人: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/04
代理公司: 苏州广正知识产权代理有限公司 32234 代理人: 刘述生
地址: 215163 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 通用型 检测 血小板 细菌 污染 荧光 定量 pcr 方法
【权利要求书】:

1.一种通用型检测血小板细菌污染的荧光定量PCR方法,其特征在于,所述荧光定量PCR方法采用一对检测细菌的通用型引物、一条适用于通用型引物的人工内参、第一条荧光标记的荧光探针和第二条荧光标记的荧光探针,所述两条荧光探针采用不同的荧光标记,所述第一条荧光探针是用于检测细菌的通用型荧光探针,所述第二条荧光探针是用于检测人工内参的内参探针,采用常规的PCR扩增技术进行检测。

2.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述一对检测细菌的通用型引物为CR5-F上游引物和CR7-R下游引物,所述CR5-F上游引物为GTGTAGCIGTGAAATGCGTAGA,所述CR7-R下游引物为TTGCGICCGTAITCCCCAGGCGG,所述第一条荧光探针为CR6-probe 探针,所述CR6-probe 探针为6FAM-CAGGATTAGATACCCTG-BHQ1,扩增产物大小为202 bp。

3.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述一对检测细菌的通用型引物为CR6-F 上游引物和CR8-R 下游引物,所述CR6-F 上游引物为TTAGATACCCTGGTAGTCCA,所述CR8-R 下游引物为GAGCTGACGACAICCITGC,所述第一条荧光探针为CR7-probe 探针,所述CR7-probe 探针为6FAM-ACTCAAAIGAATTGACGG-BHQ1,扩增产物大小为291 bp。

4.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述一对检测细菌的通用型引物为CR7-F 上游引物和CR9-R 下游引物,所述CR7-F 上游引物为GCAACGCGAAIAACCTTACC,所述CR9-R 下游引物为TGACGTCITCCCCACCTTC,所述第一条荧光探针为CR8-probe 探针,所述CR8-probe 探针为6FAM-TGAIATGTTGGGTTAAGTCC-BHQ1,扩增产物大小为243 bp。

5.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述一对检测细菌的通用型引物为23S3CD-F 上游引物和23S3CD-R 下游引物,所述23S3CD-F 上游引物为CTCAACGGATAAAAGITAC,所述23S3CD-R 下游引物为GACCIAACTGTCTCACGAC,所述第一条荧光探针为23S3CD -probe 探针,所述23S3CD -probe 探针为6FAM-TGTCGGCTCITCICATCCT -BHQ1,扩增产物大小为189 bp。

6.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述人工内参采用基因合成方式制备,两端序列和所述一对检测细菌的通用型引物完全匹配,中间80bp的序列和内参探针是人工设计的,与任何细菌及人类基因组没有任何相关性,所述人工内参的结构为5’上游引物序列-人工序列-下游引物互补序列 3’。

7.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述人工内参加入到检测样本中,可设为最低检出限或任意阈值,也可作为标准品,具有对检测结果提供质控、判读、定量参照功能。

8.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述荧光定量PCR方法中通过反转录荧光定量PCR检测样本中的RNA,与人工内参和相应DNA的Ct值进行比较,判断细菌是否为活性菌。

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