[发明专利]一种辅助诊断待测胎儿是否为21-三体综合征患者的试剂盒有效
申请号: | 201410347118.1 | 申请日: | 2014-07-21 |
公开(公告)号: | CN104152553B | 公开(公告)日: | 2016-11-23 |
发明(设计)人: | 师咏勇;沈佳薇;温祖佳 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 200030 上海市徐汇区广元*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 辅助 诊断 胎儿 是否 21 综合征 患者 试剂盒 | ||
技术领域
本发明涉及一种辅助诊断待测胎儿是否为21-三体综合征患者的试剂盒。
背景技术
21-三体综合征,又称先天愚型或Down综合征,是小儿最为常见的由常染色体畸变性所导致的出生缺陷类疾病。现代医学证实,21-三体综合征发生率与母亲怀孕年龄有相关,系21号染色体的异常(多了一条21号染色体)。高龄孕妇、卵子老化是发生不分离的重要原因。
21-三体综合征患儿的表征如下:
(1)具明显的特殊面容体征,如眼距宽、鼻根低平、眼裂小、眼外侧上斜、有内眦赘皮、外耳小、舌胖、常伸出口外、流涎多、身材矮小、头围小于正常,头前/后径短、枕部平呈扁头、颈短、皮肤宽松、骨龄常落后于年龄、出牙延迟且常错位、头发细软而较少、前囟闭合晚、顶枕中线可有第三囟门、四肢短、韧带松弛、关节可过度弯曲、手指粗短、小指中节骨发育不良使小指向内弯曲、指骨短、手掌三叉点向远端移位等,常见通贯掌纹、草鞋足,拇趾球部约半数患儿呈弓形皮纹;
(2)常呈现嗜睡和喂养困难,其智能低下表现随年龄增长而逐渐明显,智商25~50,动作发育和性发育都延迟;
(3)男性唐氏婴儿长大至青春期,也不会有生育能力;而女性唐氏婴儿长大后有月经,并且有可能生育;
(4)患儿常伴有先天性心脏病等其他畸形,因免疫功能低下,易患各种感染,白血病的发生率比一般增高10~30倍,如存活至成人期,则常在30岁以后即出现老年性痴呆症状。
羊水细胞染色体检查(羊膜腔穿刺),即在B超引导下,将针通过孕妇腹部刺入羊水中,抽取羊水,对胎儿细胞进行染色体分析,适宜孕16~20周的孕妇),是唐氏综合征产前诊断的一种有效方法。羊膜腔穿刺筛查结果为“高危”的孕妇需要经胎儿脐静脉穿刺确诊胎儿是否为唐氏综合征患儿。
发明内容
本发明的目的是提供一种辅助诊断待测胎儿是否为21-三体综合征患者的试剂盒。
本发明提供了一种辅助诊断待测胎儿是否为21-三体综合征患者的试剂盒,包括核苷酸测序仪器、samtools-0.1.19软件、21-三体综合征筛查程序和记载有如下操作规程和判断标准的载体:
(1)取一个正常对照血样本以及待测血样本,提取各个样本的基因组DNA,测序,得到各个样本的全基因组测序结果;
(2)在21-三体综合征筛查程序中调用samtools-0.1.19软件,将步骤(1)得到的正常对照血样本的全基因组测序结果以及步骤(1)得到的待测血样本的全基因组测序结果输入21-三体综合征筛查程序,输入以下命令“perl T21.pl ctrl test n,n为10以上30以下的自然数”,程序输出xi(i=1~n);
是xi(i=1~n)的平均值;sd(x)是xi(i=1~n)的标准差;
t(n-1)(x)是自由度为n-1的t分布的概率密度函数;
如果p﹤0.01,待测胎儿为候选的21-三体综合征患者;如果p﹥0.01,待测胎儿为候选的非21-三体综合征患者。如果p﹦0.01,需要进行胎儿脐静脉穿刺检查。
所述21-三体综合征筛查程序的计算机语言如下:
所述21-三体综合征筛查程序的编程语言:Perl。
所述21-三体综合征筛查程序的操作系统:Linux。
所述21-三体综合征筛查程序的运行条件:系统中已经安装samtools-0.1.19。
n具体可为20。
所述正常对照血样本具体可为已生产下正常婴儿的母亲处于孕12周-孕24周时抽取并留存的外周血。
所述待测血样本具体可为待测孕妇处于孕12周-孕24周时抽取的外周血。
所述核苷酸测序仪器可为Ion TorrentTM Personal Genome(PGM)(life techonologies)。
无创21三体产前检验能在不对母体和胎儿产生危害的情况下以较高的精度和灵敏度得到胎儿罹患21-三体综合症的风险率。
本发明的优势如下:
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