[发明专利]用于荧光原位杂交检测粪肠球菌和/或其他肠球菌的肽核酸探针组及其试剂盒、使用方法、用途有效
申请号: | 201410319903.6 | 申请日: | 2014-07-07 |
公开(公告)号: | CN104032033A | 公开(公告)日: | 2014-09-10 |
发明(设计)人: | 秦勇;何素莉;祝茂生;张丽 | 申请(专利权)人: | 玉峰惠仁生物医药科技(北京)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/01 |
代理公司: | 苏州华博知识产权代理有限公司 32232 | 代理人: | 何蔚 |
地址: | 100041 北京市石景山*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 荧光 原位杂交 检测 球菌 其他 核酸 探针 及其 试剂盒 使用方法 用途 | ||
1.用于荧光原位杂交检测粪肠球菌和/或其他肠球菌的肽核酸探针组,其特征在于:所述肽核酸探针组的DNA序列如SEQ NO:1、SEQ NO:2所示;
其中,所述SEQ NO:1序列是:5’-TTA TCC CCC TCT GAT GGG-3’,用于检测粪肠球菌;
其中,所述SEQ NO:2序列是:5’-TAC TGA TCG GCA GCT-3’,用于检测其他肠球菌;
其中,所述SEQ NO:1序列或SEQ NO:2序列可分别使用,用来分别检测粪肠球菌或其他肠球菌;也可同时使用,用来同时检测粪肠球菌和其他肠球菌。
2.如权利要求1所述的用于荧光原位杂交检测粪肠球菌和/或其他肠球菌的肽核酸探针组,其特征在于,所述肽核酸探针组能在粪肠球菌和/或其他肠球菌的rRNA、rDNA或互补的rRNA序列中检测靶序列。
3.如权利要求1所述的用于荧光原位杂交检测粪肠球菌和/或其他肠球菌的肽核酸探针组,其特征在于,所述肽核酸探针组中检测粪肠球菌的探针应至少包含86%结构上类似于SEQ NO:1的DNA序列;所述肽核酸探针组中检测其他肠球菌的探针应至少包含86%结构上类似于SEQ NO:2的DNA序列。
4.如权利要求1~3任一所述的用于荧光原位杂交检测粪肠球菌和/或其他肠球菌的肽核酸探针组,其特征在于,所述肽核酸探针组至少连接到一种可检测的级分。
5.如权利要求4所述的用于荧光原位杂交检测粪肠球菌和/或其他肠球菌的肽核酸探针组,其特征在于,所述可检测的级分的类型选自:缀合物、生色团、荧光团、放射性同位素、酶、半抗原或发光化合物。
6.如权利要求5所述的用于荧光原位杂交检测粪肠球菌和/或其他肠球菌的肽核酸探针组,其特征在于,所述荧光团基团是下列中的至少一种:荧光团Alexa系列、Alexa Fluor系列、花青苷、5-(及-6)羧基-2’、7′-二氯荧光素、5-ROX。
7.用于检测粪肠球菌和/或其他肠球菌菌株及药物敏感性的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含权利要求1~6中任一项的探针。
8.如权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包含下列溶液:固定溶液、杂交溶液及药物敏感性检测溶液;
其中,固定溶液包含多聚甲醛和乙醇;
其中,杂交溶液包含曲拉通和甲酰胺;
其中,药物敏感性检测溶液是M-H液体。
9.如权利要求8所述的试剂盒,其特征在于,所述固定溶液包含2~8%的多聚甲醛和25~75%的乙醇;所述杂交溶液的成分及组成是:10%硫酸葡聚糖,10mM NaCl,50%甲酰胺,0.1%焦磷酸钠,0.2%聚乙烯基吡咯啉,0.2%FICOLL,5mM EDTA二钠,0.1%Triton X-100,50mM Tris-HCl。
10.用于检测粪肠球菌和/或其他肠球菌菌株及药物敏感性的试剂盒的使用方法,其特征在于,所述使用方法包括下列步骤:
(a)固定:将待检样品放入固定溶液中进行固定;
(b)杂交:使肽核酸探针与待检样品在杂交溶液中接触,肽核酸探针与存在于待检样品中的微生物的靶序列杂交;
(c)洗涤:对杂交后的样品进行清洗;
(d)菌种鉴定结果观测;
(e)对数期生长的细胞在设定抗菌药物浓度的M-H液体中振荡培养;
(f)取样固定、杂交、洗涤,观测计数荧光值;
(g)计数荧光比值,确定药物敏感性。
11.如权利要求10所述的使用方法,其特征在于,所述待检样品源于血液、空气、水、食品、活组织检查及其它医学检查。
12.如权利要求11所述的使用方法,其特征在于,其杂交结果通过荧光呈现。
13.如权利要求1~6任一所述的用于荧光原位杂交检测粪肠球菌和/或其他肠球菌的肽核酸探针组的用途,其特征在于,所述肽核酸探针组用于样品中粪肠球菌和/或其他肠球菌的检测。
14.如权利要求7~9任一所述的用于检测粪肠球菌和/或其他肠球菌菌株及药物敏感性的试剂盒的用途,其特征在于,所述试剂盒用于生物学样品中粪肠球菌和/或其他肠球菌的鉴定及其药物敏感性的检测。
15.如权利要求10~12任一所述的使用方法的用途,其特征在于,所述使用方法用于样品中粪肠球菌和/或其他肠球菌的鉴定及其药物敏感性的检测。
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