[发明专利]一种桉树焦枯病原菌的LAMP检测试剂盒及其使用方法有效
申请号: | 201410273167.5 | 申请日: | 2014-06-18 |
公开(公告)号: | CN104164486A | 公开(公告)日: | 2014-11-26 |
发明(设计)人: | 朱天辉;张静;朱涵明月;李姝江;谯天敏;韩珊;王淋敏;张丽娜 | 申请(专利权)人: | 四川农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 | 代理人: | 龚燮英 |
地址: | 611130 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 桉树 焦枯 病原菌 lamp 检测 试剂盒 及其 使用方法 | ||
1.一种桉树焦枯病原菌的LAMP检测试剂盒,其特征在于,其包括:
(1)10×ThermopolⅡ;
(2)100mMMgCl2;
(3)2.5mMdNTPs;
(4)5M甜菜碱溶液;
(5)ddH2O;
(6)40μM的内引物FIP和BIP,10μM的外引物F3和B3;10μM的环状引物LooPF和LooPB;其中,前内引物FIP的序列为5'-TGCGCGCTCTTTCGCTACATACACAACGGTACCTCCGACC-3',后内引物BIP的序列为5'-CGCTCACCCTGCGAGAAACAGCGCGAGGAACATACTTGTT-3',前外引物F3的序列为5'-CTCGACAGCAATGGTGTCT-3',后外引物B3的序列为5'-GCTCAAGATCGACGAGGAC-3',环状引物LooPF的序列为5'-GTAGACGTTCATGCGCTCC-3',环状引物LooPB的序列为5'-ATTATTTGTGAGTGTGATAG-3';
(7)8UBstDNA聚合酶大片;
(8)SYBRGreenI荧光染料。
2.根据权利要求1所述的LAMP检测试剂盒的使用方法,其特征是,其步骤如下:
(1)提取纯培养菌株基因组DNA或所取植物组织样总DNA;
(2)所述的反应体系50μL,包含:10×ThermopolⅡ2.5μl;100mMMgCl22μl;2.5mMdNTPs3.5μl;5M甜菜碱溶液3.0μl;ddH2O33.0μl;40μM内引物FIP/BIP各1μl;10μM外引物F3/B3各0.5μl;10μM环状引物LooPF/LooPB各1μl;8UBstDNA聚合酶大片1μl;加纯培养菌株基因组DNA或所取植物组织样总DNA提取液2.0μL,组成反应混合液;
(3)PCR反应条件为:将反应混合液置于65℃的水浴锅中反应65min,随后80℃灭活3min结束反应;
(4)结果判定:①用肉眼观察反应液是否为白色浑浊,白色浑浊即为阳性,否则为阴性;②将反应产物PCR管放在紫外灯下照射,若有白色则说明样品中存在桉树焦枯病原菌,无白色则说明不含桉树焦枯病原菌;③在扩增产物中加入SYBRGreenI荧光染料观察颜色变化,反应液颜色由橙色变成绿色为阳性,颜色保持不变为阴性;④扩增结束后取5.0μLPCR产物上样于含0.5μg/mLEB的2%琼脂糖凝胶上电泳,电压为9V/cm、时间为30min,在凝胶成像系统上检测并拍照,观察是否产生特征性梯状电泳条带,有条带则说明样品中存在桉树焦枯病原菌,无条带则说明不含桉树焦枯病原菌。
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