[发明专利]一种检测牛GHR基因的特异性引物、其荧光定量PCR检测试剂盒及其检测方法和应用在审
申请号: | 201410253556.1 | 申请日: | 2014-06-10 |
公开(公告)号: | CN104313125A | 公开(公告)日: | 2015-01-28 |
发明(设计)人: | 裴杰;褚敏;梁春年;郭宪;包鹏甲;冯瑞林;朱新书;丁学智;阎萍 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京中恒高博知识产权代理有限公司 11249 | 代理人: | 高松 |
地址: | 730000 甘肃省*** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 ghr 基因 特异性 引物 荧光 定量 pcr 试剂盒 及其 方法 应用 | ||
技术领域
本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种检测牛GHR基因的特异性引物和牛GHR基因荧光定量PCR检测试剂盒。
背景技术
聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)是DNA体外操作技术中最常用的技术。PCR技术将模板DNA、特异性引物、dNTPs底物、耐热DNA聚合酶、镁离子等放在同一个缓冲反应体系中,进行反复高温变性、低温退火、中温链延伸的热循环,实现靶DNA片段在反应液中呈2n倍扩增(其中n为热循环次数)。
荧光定量PCR技术是在变通PCR反应的基础上,结合实时荧光检测技术和计算机分析技术。荧光定量PCR在变通PCR反应体系中加入特定的荧光标记物质,通过检测每个热循环后PCR反应体系中的荧光值的变化情况来实时监测DNA的扩增情况,并获得每个样本的荧光定量变化曲线,进而获得每个反应管的Ct值(荧光变化达到阈值时的循环数);同时,在相同的反应体系和反应条件下检测2-10个倍数稀释的已知数量的靶标DNA,获得其Ct值,以起始模板数的对数为横坐标,以Ct值为纵坐标制备标准曲线,据此标准曲线和各个标本的Ct值对每个反应的起始DNA模板数进行定量测定。
虽然Northern blot技术可检测基因的mRNA表达水平,但整个实验过程操作比较复杂。Northern blot实验中一个主要的问题是存在RNA的降解,所以Northern Blot中所有的实验用品都需要经过除去RNA酶的过程,如高温烘烤、DEPC处理等。另外,Northern Blot中很多实验用品如甲醛、EB、DEPC、紫外灯等等对人体都有一定的伤害。基因芯片实验虽然降低了实验人员的工作量,并可以在一次实验中同时检测几千个基因表达量变化,但是其灵敏度较低。
而SYBR Green是一种结合于双链DNA小沟中的结合染料。与双链DNA结合后,其荧光大大增强。该性质用于扩增产物的检测非常理想。SYBR Green的最大吸收波长约为497 nm,发射波长最大约为520 nm。在 PCR 反应体系中,加入过量SYBR荧光染料,SYBR荧光染料特异性地掺入DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的 SYBR 染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与PCR产物的增加完全同步。
SYBR Green在核酸的实时检测方面有很多优点,由于它与所有的双链DNA相结合,不必因为模板不同而特别定制,因此设计的程序通用性好,且价格相对较低。此外,由于一个PCR产物可以与多分子的染料结合,因此SRYB Green的灵敏度很高。但是,由于SYRB Green与所有的双链DNA相结合,因此由引物二聚体、单链二级结构以及错误的扩增产物引起的假阳性会影响定量的精确性。通过测量升高温度后荧光的变化可以帮助降低非特异产物的影响。由解链曲线来分析产物的均一性有助于分析由SYBR Green得到定量结果。
生长激素(Growth Hormone,GH)是调节动物生长发育的一个重要分泌因子。GH在组织和细胞水平发挥作用的第一步就是和靶细胞表面的GHR结合,再由GHR介导将信号传入细胞内从而产生一系列的生理效应。组织中GHR量的多少将影响GH生理效应的发挥。因此,在牛的饲养过程中和科学研究中,可以定量检测组织中GHR的表达量,达到监测牛的发育状况的目的。
发明内容
本发明提供了一种牛生长激素受体(Growth Hormone Receptor,GHR)基因的荧光定量PCR检测试剂盒。通过大量的实验研究,我们优化出了一套能够有效检测不同牛种(包括奶牛、黄牛和牦牛)GHR基因表达量的引物和PCR反应的条件,并组装成GHR基因表达检测荧光定量聚合酶链式反应试剂盒,以满足生命科学、医学和畜牧兽医研究者的检测需要。为此,本发明还提供检测牛GHR基因的特异性引物、检测方法和试剂盒的应用。
为了实现上述发明目的,本发明提供的技术方案如下:
一种检测牛GHR基因的特异性引物,其核苷酸序列为:
上游序列为5’-AACCACCACCCAATACAG-3’,
下游序列为5’-CAACGAGTACATCGGAAC-3’。
本发明还提供一种牛GHR基因的荧光定量PCR检测试剂盒,所述试剂盒包括PCR反应液、Taq DNA 聚合酶混合物、 SYBR Green染料和引物;所述引物序列为:
上游序列为5’-AACCACCACCCAATACAG-3’,
下游序列为5’-CAACGAGTACATCGGAAC-3’。
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