[发明专利]虫媒病毒液相芯片三重检测方法有效

专利信息
申请号: 201410247111.2 申请日: 2014-06-06
公开(公告)号: CN104120191A 公开(公告)日: 2014-10-29
发明(设计)人: 李云峰;蔡鹏;龙川凤;赵亮;葛藤 申请(专利权)人: 李云峰
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93
代理公司: 大连科技专利代理有限责任公司 21119 代理人: 龙锋
地址: 116001 辽*** 国省代码: 辽宁;21
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摘要:
搜索关键词: 虫媒病毒 芯片 三重 检测 方法
【权利要求书】:

1.虫媒病毒液相芯片三重检测方法,其特征在于,包括如下步骤:

1) 设计引物并对下游引物进行生物素标记,在引物特异性验证成功后,进行虫媒病毒多重PCR扩增,其中所述虫媒病毒为基孔肯雅病毒CHIKV、克里米亚- 刚果出血病毒CCHFV和裂谷热病毒RVFV三种,其中多重PCR扩增反应体系为: 

反应条件为:95 ℃,10 min;94 ℃,30 s,55 ℃,30 s,72 ℃,30 s,35 cycles;72 ℃,10 min;4℃,hold;所述混合引物为上下游引物的混合物,上下游引物的浓度比为1:1-1:8;反应体系中所述模板可以为模板1、2、3种的任意一种或任意两种组合或三种;

2) 设计核酸探针并进行氨基化修饰,与荧光编码微球偶联制得微球混合液;

3) 设计偶联质控探针并加入到步骤2)得到的微球混合液进行偶联质量控制,所述偶联质控探针序列与步骤2)所述核酸探针序列互补;

4) 将PCR产物与微球混合液进行杂交反应,同时加入用核酸检测缓冲液稀释的链霉素-藻红蛋白,并通过液相芯片检测仪对反应产物进行分析。

2.根据权利要求1所述的虫媒病毒液相芯片三重检测方法,其特征在于,所述基孔肯雅病毒CHIKV、裂谷热病毒RVFV和克里米亚-刚果出血热CCHF的引物序列为:

3.根据权利要求1所述的虫媒病毒液相芯片三重检测方法,其特征在于,所述上下游引物的浓度比为1:8。

4.根据权利要求1所述的虫媒病毒液相芯片三重检测方法,其特征在于,所述核酸探针和偶联质控探针的序列为:

5.根据权利要求4所述的虫媒病毒液相芯片三重检测方法,其特征在于,所述序列中每个核酸探针的5端加10个poly(T),再加氨基修饰,并对偶联质控探针的5端进行了生物素标记。

6.根据权利要求1所述的虫媒病毒液相芯片三重检测方法,其特征在于,步骤2)所述偶联微球混合液通过如下步骤制得:

1) 随机选取带有不同编号的羧基化微球并活化;

2) 向活化微球中各加入100 pmol/μL的氨基化修饰的核酸探针3-5 μL,瞬时震荡;

3) 再各加3 μL核酸偶联活化剂,即10 mg/mL 的EDC到上述微球中,瞬时震荡;

4) 室温避光孵育30-45min;

5) 向上述微球中各加200 μL核酸偶联洗涤液A ,即0.02% 吐温-20,全速震荡5min;

6) 12,000×g 离心微球10min;

7) 弃上清,向上述微球中加入200μL核酸偶联洗涤液B,即0.1% SDS,全速震荡5min;

8) 12,000×g 离心微球10min;

9) 弃上清,不要触动沉淀;

10) 各加入100μL 核酸偶联微球贮存液,全速震荡或超声波悬浮微球5min制得偶联微球混合液。

7.根据权利要求1所述的虫媒病毒液相芯片三重检测方法,其特征在于,步骤3)偶联质量控制包括如下步骤:

1) 取偶联混合微球5μL,加入到1.5 mL离心管中,并用核酸检测缓冲液1, 即1.5×TMAC,稀释至33μL;

2) 将偶联质控探针稀释至0.01μM的混合液,取7μL偶联质控探针混合液,加入到含上述33μL微球混合液的1.5mL离心管中;

3) 然后用核酸检测缓冲液2 ,即1.0×TMAC,补足体积至50μL,52℃避光孵育15min;

4) 加入25μL 的10μg/mL SAPE,混匀,52℃避光孵育5min,加入反应终止液50μL;

5)  液相芯片系统中进行测试,判断标准:空白质控荧光信号中值小于100,偶联质控荧光信号中值大于1000。

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