[发明专利]虫媒病毒液相芯片三重检测方法有效
| 申请号: | 201410247111.2 | 申请日: | 2014-06-06 |
| 公开(公告)号: | CN104120191A | 公开(公告)日: | 2014-10-29 |
| 发明(设计)人: | 李云峰;蔡鹏;龙川凤;赵亮;葛藤 | 申请(专利权)人: | 李云峰 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
| 代理公司: | 大连科技专利代理有限责任公司 21119 | 代理人: | 龙锋 |
| 地址: | 116001 辽*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 虫媒病毒 芯片 三重 检测 方法 | ||
1.虫媒病毒液相芯片三重检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
1) 设计引物并对下游引物进行生物素标记,在引物特异性验证成功后,进行虫媒病毒多重PCR扩增,其中所述虫媒病毒为基孔肯雅病毒CHIKV、克里米亚- 刚果出血病毒CCHFV和裂谷热病毒RVFV三种,其中多重PCR扩增反应体系为:
反应条件为:95 ℃,10 min;94 ℃,30 s,55 ℃,30 s,72 ℃,30 s,35 cycles;72 ℃,10 min;4℃,hold;所述混合引物为上下游引物的混合物,上下游引物的浓度比为1:1-1:8;反应体系中所述模板可以为模板1、2、3种的任意一种或任意两种组合或三种;
2) 设计核酸探针并进行氨基化修饰,与荧光编码微球偶联制得微球混合液;
3) 设计偶联质控探针并加入到步骤2)得到的微球混合液进行偶联质量控制,所述偶联质控探针序列与步骤2)所述核酸探针序列互补;
4) 将PCR产物与微球混合液进行杂交反应,同时加入用核酸检测缓冲液稀释的链霉素-藻红蛋白,并通过液相芯片检测仪对反应产物进行分析。
2.根据权利要求1所述的虫媒病毒液相芯片三重检测方法,其特征在于,所述基孔肯雅病毒CHIKV、裂谷热病毒RVFV和克里米亚-刚果出血热CCHF的引物序列为:
。
3.根据权利要求1所述的虫媒病毒液相芯片三重检测方法,其特征在于,所述上下游引物的浓度比为1:8。
4.根据权利要求1所述的虫媒病毒液相芯片三重检测方法,其特征在于,所述核酸探针和偶联质控探针的序列为:
。
5.根据权利要求4所述的虫媒病毒液相芯片三重检测方法,其特征在于,所述序列中每个核酸探针的5’端加10个poly(T),再加氨基修饰,并对偶联质控探针的5‘端进行了生物素标记。
6.根据权利要求1所述的虫媒病毒液相芯片三重检测方法,其特征在于,步骤2)所述偶联微球混合液通过如下步骤制得:
1) 随机选取带有不同编号的羧基化微球并活化;
2) 向活化微球中各加入100 pmol/μL的氨基化修饰的核酸探针3-5 μL,瞬时震荡;
3) 再各加3 μL核酸偶联活化剂,即10 mg/mL 的EDC到上述微球中,瞬时震荡;
4) 室温避光孵育30-45min;
5) 向上述微球中各加200 μL核酸偶联洗涤液A ,即0.02% 吐温-20,全速震荡5min;
6) 12,000×g 离心微球10min;
7) 弃上清,向上述微球中加入200μL核酸偶联洗涤液B,即0.1% SDS,全速震荡5min;
8) 12,000×g 离心微球10min;
9) 弃上清,不要触动沉淀;
10) 各加入100μL 核酸偶联微球贮存液,全速震荡或超声波悬浮微球5min制得偶联微球混合液。
7.根据权利要求1所述的虫媒病毒液相芯片三重检测方法,其特征在于,步骤3)偶联质量控制包括如下步骤:
1) 取偶联混合微球5μL,加入到1.5 mL离心管中,并用核酸检测缓冲液1, 即1.5×TMAC,稀释至33μL;
2) 将偶联质控探针稀释至0.01μM的混合液,取7μL偶联质控探针混合液,加入到含上述33μL微球混合液的1.5mL离心管中;
3) 然后用核酸检测缓冲液2 ,即1.0×TMAC,补足体积至50μL,52℃避光孵育15min;
4) 加入25μL 的10μg/mL SAPE,混匀,52℃避光孵育5min,加入反应终止液50μL;
5) 液相芯片系统中进行测试,判断标准:空白质控荧光信号中值小于100,偶联质控荧光信号中值大于1000。
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