[发明专利]HIF2A基因突变体及其检测与应用有效
申请号: | 201410172171.2 | 申请日: | 2014-04-25 |
公开(公告)号: | CN103993016A | 公开(公告)日: | 2014-08-20 |
发明(设计)人: | 李兰娟;曹红翠;苏晓茹;俞炯 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C07K14/47;C12Q1/68 |
代理公司: | 杭州中成专利事务所有限公司 33212 | 代理人: | 周世骏 |
地址: | 310058 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | hif2a 基因 突变体 及其 检测 应用 | ||
1.一种分离的编码HIF2A突变体核酸,其特征在于,该突变体核酸的基因序列如SEQ ID NO:1所示。
2.一种分离的HIF2A突变体多肽,其特征在于,该突变体多肽是由权利要求1所述突变体核酸编码的,其氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。
3.一种检测生物样品是否存在HIF2A基因突变的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)确定在生物样品中是否具备HIF2A基因编码的SEQ ID NO:2所示的第549位氨基酸,或者SEQ ID NO:1所示的第2155位核苷酸;
该步骤具体包括:利用HIF2A基因的第12外显子特异性的引物,对核酸样本进行PCR扩增,针对所得的扩增产物构建核酸测序文库并进行测序;
所述的生物样品是指分离自人体的血液、各种器官的组织、皮肤、毛发或口腔黏膜,能够用于分离获得权利要求1中所述突变体核酸,或者是通过反转录反应获得cDNA样本以构成所述核酸样本;
所述HIF2A基因的第12外显子特异性的引物具有如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列;
(2)检测在所述核苷酸位置是否存在G→A突变,以及所述氨基酸序列是否存在E→K突变;
该步骤具体包括:通过比对测序核苷酸图谱,第2155位核苷酸由G变为A,CDS编码序列上看是第1645位核苷酸发生突变,即发生c.G1645A突变,密码子GAG变为AAG,翻译后氨基酸序列第549个谷氨酸(E)变为赖氨酸(K),即发生p.E549K突变。
4.权利要求1所述编码HIF2A突变体核酸在制备用于检测生物样品是否存在HIF2A基因突变的试剂盒中的应用。
5.权利要求1所述编码HIF2A突变体多肽在制备用于检测生物样品是否存在HIF2A基因突变的试剂盒中的应用。
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