[发明专利]一种鉴定稻瘟病抗性基因Pi-ta和Pi-b的多重PCR方法有效
申请号: | 201410152098.2 | 申请日: | 2014-04-15 |
公开(公告)号: | CN103937890A | 公开(公告)日: | 2014-07-23 |
发明(设计)人: | 姚姝;陈涛;王才林;刘燕清;张亚东;朱镇;赵庆勇;周丽慧;赵凌;于新;赵春芳 | 申请(专利权)人: | 江苏省农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 张素卿 |
地址: | 210014*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 稻瘟病 抗性 基因 pi ta 多重 pcr 方法 | ||
1.一种鉴定稻瘟病抗性基因Pi-ta和Pi-b的多重PCR方法,其特征在于:
利用PCR反应体系I中,
抗病等位基因Pi-ta特异性引物:
正向Pi-ta-F序列:5'-AGCAGGTTATAAGCTAGGCC-3'
反向Pi-ta-R序列:5'-CTACCAACAAGTTCATCAAA-3'
抗病等位基因Pi-b特异性引物:
正向Pi-b-F序列:5'-GAACAATGCCCAAACTTGAGA-3'
反向Pi-b-R序列:5'-TGGTCCACATGTCAGTGAGC-3'
和PCR反应体系Ⅱ中,
感病等位基因pi-ta特异性引物:
正向pi-ta-F序列:5'-AGCAGGTTATAAGCTAGCTAT-3'
反向pi-ta-R序列:5'-CTACCAACAAGTTCATCAAA-3'
感病等位基因pi-b特异性引物:
正向pi-b-F序列:5'-TCGGTGCCTCGGTAGTCAGT-3'
反向pi-b-R序列:5'-TGGAAGCGGATCCTAGGTCT-3'
同时扩增水稻品种的基因组DNA,如果体系I所用两对引物能同时扩增出1,042 bp和365 bp两条特征条带,即为含Pi-ta和Pi-b基因的纯合体;如果体系Ⅱ所用两对引物能同时扩增出1,042 bp和803 bp两条特征条带,即为含pi-ta与pi-b基因的纯合体;如果体系I和体系Ⅱ分别扩增出1,042 bp和803 bp的特征条带,则为含Pi-ta与pi-b基因的纯合个体;如果体系I和体系Ⅱ分别扩增出365 bp和1,042 bp,则为含pi-ta与Pi-b基因的纯合个体。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:
(1)水稻植株基因组DNA的提取;
(2)将权利要求1所述的稻瘟病抗病等位基因Pi-ta特异性引物与Pi-b特异性引物加入PCR反应体系I中,同时将权利要求1所述的感病等位基因pi-ta特异性引物与pi-b特异性引物加入PCR反应体系Ⅱ中,并对水稻种质资源或育种群体植株的DNA进行扩增;
(3)PCR反应体系I和Ⅱ中20 μL PCR反应体系包括:10 ng/μL的 DNA 2.0 μL,含25 mmol/L MgCl2的10×PCR Buffer 2.0 μL,2.5 mmol/L的dNTP 0.4 μL,5 U/μL 的Taq0.5 μL,ddH2O 13.1 μL和4 pmol/ μL的引物2.0 μL :其中体系I中为引物Pi-ta-F、Pi-ta-R、Pi-b-F和Pi-b-R各0.5 μL,体系Ⅱ中为引物pi-ta-F、pi-ta-R、pi-b-F和pi-b-R各0.5 μL;
(4)PCR反应体系I和Ⅱ中的程序包括:95℃预变性3 min;然后94℃变性1 min,55℃复性 1 min,72℃延伸1 min,6个循环;再进行94℃变性1 min,55℃复性50 s,72℃延伸30 s,32个循环,最后72℃延伸6 min,10℃冷却10 min后,将扩增产物加上样缓冲液终止反应;
(5)反应产物在质量比浓度为1.5%的琼脂糖凝胶上电泳,经溴化乙锭染色并于凝胶成像。
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