[发明专利]一种鉴定稻瘟病抗性基因Pi-ta和Pi-b的多重PCR方法有效

专利信息
申请号: 201410152098.2 申请日: 2014-04-15
公开(公告)号: CN103937890A 公开(公告)日: 2014-07-23
发明(设计)人: 姚姝;陈涛;王才林;刘燕清;张亚东;朱镇;赵庆勇;周丽慧;赵凌;于新;赵春芳 申请(专利权)人: 江苏省农业科学院
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 代理人: 张素卿
地址: 210014*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 鉴定 稻瘟病 抗性 基因 pi ta 多重 pcr 方法
【权利要求书】:

1.一种鉴定稻瘟病抗性基因Pi-taPi-b的多重PCR方法,其特征在于:

利用PCR反应体系I中,

抗病等位基因Pi-ta特异性引物:

正向Pi-ta-F序列:5'-AGCAGGTTATAAGCTAGGCC-3'

反向Pi-ta-R序列:5'-CTACCAACAAGTTCATCAAA-3'

抗病等位基因Pi-b特异性引物:

正向Pi-b-F序列:5'-GAACAATGCCCAAACTTGAGA-3'

反向Pi-b-R序列:5'-TGGTCCACATGTCAGTGAGC-3'

和PCR反应体系Ⅱ中,

感病等位基因pi-ta特异性引物:

正向pi-ta-F序列:5'-AGCAGGTTATAAGCTAGCTAT-3'

反向pi-ta-R序列:5'-CTACCAACAAGTTCATCAAA-3'

感病等位基因pi-b特异性引物:

正向pi-b-F序列:5'-TCGGTGCCTCGGTAGTCAGT-3'

反向pi-b-R序列:5'-TGGAAGCGGATCCTAGGTCT-3'

同时扩增水稻品种的基因组DNA,如果体系I所用两对引物能同时扩增出1,042 bp和365 bp两条特征条带,即为含Pi-taPi-b基因的纯合体;如果体系Ⅱ所用两对引物能同时扩增出1,042 bp和803 bp两条特征条带,即为含pi-tapi-b基因的纯合体;如果体系I和体系Ⅱ分别扩增出1,042 bp和803 bp的特征条带,则为含Pi-tapi-b基因的纯合个体;如果体系I和体系Ⅱ分别扩增出365 bp和1,042 bp,则为含pi-taPi-b基因的纯合个体。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:

(1)水稻植株基因组DNA的提取;

(2)将权利要求1所述的稻瘟病抗病等位基因Pi-ta特异性引物与Pi-b特异性引物加入PCR反应体系I中,同时将权利要求1所述的感病等位基因pi-ta特异性引物与pi-b特异性引物加入PCR反应体系Ⅱ中,并对水稻种质资源或育种群体植株的DNA进行扩增;

(3)PCR反应体系I和Ⅱ中20 μL PCR反应体系包括:10 ng/μL的 DNA 2.0 μL,含25 mmol/L MgCl2的10×PCR Buffer 2.0 μL,2.5 mmol/L的dNTP 0.4 μL,5 U/μL 的Taq0.5 μL,ddH2O 13.1 μL和4 pmol/ μL的引物2.0 μL :其中体系I中为引物Pi-ta-F、Pi-ta-R、Pi-b-F和Pi-b-R各0.5 μL,体系Ⅱ中为引物pi-ta-F、pi-ta-R、pi-b-F和pi-b-R各0.5 μL; 

(4)PCR反应体系I和Ⅱ中的程序包括:95℃预变性3 min;然后94℃变性1 min,55℃复性 1 min,72℃延伸1 min,6个循环;再进行94℃变性1 min,55℃复性50 s,72℃延伸30 s,32个循环,最后72℃延伸6 min,10℃冷却10 min后,将扩增产物加上样缓冲液终止反应;

(5)反应产物在质量比浓度为1.5%的琼脂糖凝胶上电泳,经溴化乙锭染色并于凝胶成像。

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