[发明专利]一种与小型猪2型糖尿病有关的SNP标记、其检测方法和用途有效
申请号: | 201410137904.9 | 申请日: | 2014-04-08 |
公开(公告)号: | CN103937787B | 公开(公告)日: | 2017-01-04 |
发明(设计)人: | 郭亚芬;兰干球;蒋钦杨;杨辉 | 申请(专利权)人: | 广西大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京中誉威圣知识产权代理有限公司11279 | 代理人: | 王正茂 |
地址: | 530004 广西*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 小型 糖尿病 有关 snp 标记 检测 方法 用途 | ||
1.一种与小型猪2型糖尿病易感性相关的SNP标记,其特征在于,所述SNP标记是在小型猪Leptin基因的1号外显子325bp处的G/A多态,具有该SNP标记的Leptin基因的1号外显子核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
2.检测权利要求1所述的SNP标记的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取小型猪的基因组DNA;
(2)用已提取的小型猪基因组DNA为模板,使用核苷酸序列如SEQ ID NO:2和SEQIDNO:3所示的引物来进行PCR扩增;
(3)将PCR扩增产物测序,分析测序结果,判读在1号外显子325bp处的G/A多态。
3.按照权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(3)中,将PCR产物先经琼脂糖凝胶电泳检测,回收目的片段后再进行测序。
4.按照权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(2)所述的PCR扩增反应体系为:DNA模板3μL、SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示的引物各2μL、PCR Mix试剂25μL、双蒸水18μL;其中,所述DNA模板浓度为30ng/μL,所述引物的浓度为25μmol/L,所述PCRMix试剂为北京康为世纪生物科技有限公司的CW0716型号试剂。
5.按照权利要求4所述的方法,其特征在于,PCR扩增的反应程序为:预变性94℃5min;变性98℃10s,退火61℃30s,延伸72℃30~60s,35个循环;延伸72℃7~10min。
6.检测权利要求1所述的SNP标记所用的引物,其特征在于:所述引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示。
7.权利要求1所述的SNP标记在筛选对2型糖尿病易感或抵抗的小型猪品系中的用途。
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