[发明专利]大肠杆菌O157:H7的LAMP检测引物及检测试剂盒有效
| 申请号: | 201410130191.3 | 申请日: | 2014-04-02 |
| 公开(公告)号: | CN103866030A | 公开(公告)日: | 2014-06-18 |
| 发明(设计)人: | 张雪寒;汪伟;何孔旺;倪艳秀;温立斌;李彬;周俊明;王小敏 | 申请(专利权)人: | 江苏省农业科学院 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/19 |
| 代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 张素卿 |
| 地址: | 210014*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 大肠杆菌 o157 h7 lamp 检测 引物 试剂盒 | ||
一、技术领域
本发明涉及检测大肠杆菌O157:H7的LAMP引物及检测试剂盒,属于生物和食品检测领域。
二、背景技术
大肠杆菌(Escherichia coli, E.coli)O157:H7是重要的食源性病原菌,能够在全世界范围内引起动物、家禽和人类爆发感染,不仅关乎食品安全,而且与医疗和公共卫生问题密切相关。
现如今,许多报道尝试研制更特异的方法检测E.coli O157:H7。传统的培养鉴定技术使用选择性培养基或者显色平板检测E.coli O157:H7,但是这种方法费时,费力,准确性差。 PCR技术和定量PCR检测技术已经被广泛应用各检测领域,发挥着不可忽视的作用,但对仪器设备等要求较高,不适合快速和临床样品的检测。我们前期研究工作中,通过对已有E.coli O157:H7全基因组序列生物信息学,比对分析,发现新的阅读框编码鞭毛类基因,它唯一的存在于E.coli O157:H7基因组中,为适应更广泛领域检测的需要,有必要建立新型的检测技术。
环介导等温扩增技术(LAMP)是由日本学者T.Notomi发明的一种新型核酸扩增技术。该技术依赖于4条特异设计的引物和一种具有链置换特性的DNA聚合酶,在等温条件下可以高效、高特异性地扩增靶序列。近年来,国内外已经将该技术广泛应用于病原检测,如LAMP可以检测多种病原菌,例如沙门氏杆菌、李氏杆菌、大肠杆菌等。目前未见能够特异性和专一性检测大肠杆菌O157:H7 LAMP的报道。
本发明的大肠杆菌O157:H7 LAMP检测技术避免了现有检测手段存在的某些问题,相比较其他检测手段,建立的大肠杆菌O157:H7 LAMP方法具有敏感性高、特异性强、检测周期短、操作简单方便的特点。
三、发现内容
技术问题 本发明目的在于克服现有技术的不足,提供一种特异性检测大肠杆菌O157:H7 LAMP检测试剂盒及其检测方法。本发明的试剂盒使用方便,结果鉴定直观,检测敏感性和特异性高,并且易于大范围推广使用。
技术方案
本发明是通过以下技术方案实现的。
本发明设计一种大肠杆菌O157:H7 LAMP检测试剂盒,该试剂盒包括以下4条引物,所述引物序列分别如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示。
所述试剂盒包括反应液A和SYBR Green I,所述反应液A具体包括:每23 uL的反应体系包括10×ThermoPol Reaction Buffer(美国NEB公司)2.5 uL、2.5mM dNTPs 2 uL、1M 的Mg2SO4 4 uL、8U/ uL Bst DNA酶(美国NEB公司) 1 uL、超纯水12.5 uL,以及如下的引物:
5 μM碱基序列如SEQ ID NO.1 和SEQ ID NO.2所示的引物各0.25 uL,50 μM碱基序列如SEQ ID NO.3 和SEQ ID NO.4所示的引物各0.25 uL。
本发明还涉及一种利用所述大肠杆菌O157:H7 LAMP检测试剂盒的检测方法,包括以下步骤:
(1)待检模板的制备:
粪便或者食物10克,加入到90mL磷酸盐缓冲液中,37℃震荡2h后,取1mL加入到9mL心脑浸出液培养基中;如果待检样品为液体,则直接取1mL加入到9mL心脑浸出液培养基中;培养基中再加入100 uL 浓度为50mg/mL新生霉素,37℃继续培养18h,吸取1mL培养物,500 r离心15min,弃沉淀,吸取上清至新离心管,12000r离心10min,弃上清,取沉淀重悬于1/10体积双蒸水中,沸水浴10min,4℃12000转离心10min,吸取上清,即待检模板DNA。
(2)取2 uL提取的待检模板加入到所述的反应液A中,终体积为25 uL,混匀,置于64℃恒温50 min进行LAMP扩增;
(3)结果判定:取出上述扩增反应管,在其中加入1 uL20×SYBR Green I,如反应管中液体变为绿色,则说明样品中含有大肠杆菌O157:H7;如果颜色为橘黄色,则说明样品中不含有大肠杆菌O157:H7。
有益效果
与现有技术相比,本发明的有益效果如下:
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