[发明专利]用于检测禽流感病毒N9亚型的RT-PCR引物对、试剂盒及检测方法在审
| 申请号: | 201410106522.X | 申请日: | 2014-03-21 |
| 公开(公告)号: | CN104017902A | 公开(公告)日: | 2014-09-03 |
| 发明(设计)人: | 孙明;陈西钊;乔明明;冯向辉;王传彬;才学鹏 | 申请(专利权)人: | 北京世纪元亨动物防疫技术有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 北京海虹嘉诚知识产权代理有限公司 11129 | 代理人: | 吴泳历;曹治丽 |
| 地址: | 100085 北京市*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 检测 禽流感 病毒 n9 rt pcr 引物 试剂盒 方法 | ||
技术领域
本发明属于病毒检测领域,涉及用于检测禽流感病毒N9亚型的引物对、试剂盒及检测方法。
背景技术
禽流感(avian influenza)是由禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)引起的一种主要流行于鸡群中的烈性传染病。高致病力毒株可致禽类突发死亡,是国际兽疫局规定的A类疫病,也能感染人。禽流感病毒属于正粘病毒科(Orthomyxoviridae)A型流感病毒属。根据核蛋白(NP)和基质蛋白(MP)的不同,流感病毒共分3个型,即A,B和C型,每个型内的毒株都有基本相同的NP和MP,也就是说NP和MP具有型特异性。AIV属A型流感病毒,在正粘病毒属中A型流感病毒是唯一感染禽类的病毒型。根据AIV囊膜表面糖蛋白血凝素和神经氨酸酶的不同可以分为好多亚型,目前已分离到17种特异的HA抗原(H1-H17)和10种不同的NA抗原(N1-N10)。禽流感不仅严重危害禽类,而且危害哺乳动物,尤其是可感染人并致人死亡,极大的威胁人类公共卫生安全。H7N9(Influenza A virus subtype H7N9)是一种甲型流感病毒,是禽流感病毒的一个亚型,因病毒在鸟类的死亡率低,经基因交换后转移到人类上感染后成为病发期短、重症率与死亡率均相对于SARS略高而引发社会注意。H7N9原属于低致病性病毒,仅在禽间发现,2013年3月下旬,人类感染甲型流感H7N9病毒的病例被发现,这是该病毒全球首次感染人类。目前,进行N9亚型分型的主要是神经氨酸酶抑制试验,耗时、麻烦等诸多问题,并且现有技术中并没有检测禽流感病毒N9亚型的RT-PCR检测试剂盒以及方法,因此,建立一种特异性强、敏感性高、可靠性好的检查方法意义重大。
发明内容
根据上述领域的需求和不足,本发明提供一种用于检测禽流感病毒N9亚型的引物对、试剂盒及检测方法。本发明所述引物对检测禽流感病毒N9亚型的特异性强、灵敏度高。
本发明通过以下技术方案实现的:
本文所列出的核苷酸序列,均由5’端向3’端方向书写。
本发明的一个方面提供一种引物对,所述引物对由两条引物组成,其中一条引物AIV-N9-F3包含如SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列,另一条引物AIV-N9-R3包含如SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列,所述核苷酸序列如下:
5’-GCTGGCCACTATCATCACC-3’(AIV-N9-F3,SEQ ID NO:3);
5’-TCGTTCCCCGTAACATGA-3’(AIV-N9-R3,SEQ ID NO:6)。
本发明还提供包含上述引物对的组合物。
此外,本发明还提供一种用于检测禽流感病毒N9亚型的试剂盒,其特征在于,包含上述的组合物。
所述的试剂盒还包含RT-PCR反应液、酶混合液、所述的RT-PCR反应液由上述的引物对、反应缓冲液和dNTPs混合在一起;所述酶混合液由RNA酶抑制剂、反转录酶和Taq DNA聚合酶按3:2:10混合在一起。
所述试剂盒还包含一种X液,所述的X液为一对引物,所述引物对只要满足可对阳性对照的RNA进行扩增,扩增的片段长度与禽流感病毒N9亚型所检测的目的基因长度相同即可。
本发明中优选使用的X液为自行设计的引物对,其中一条引物包含如SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列,另一条引物包含如SEQ ID NO:8所示核苷酸序列。
本发明中优选使用的X液的上游引物N9UND-F:TGGAGTAGAGTACGCTCAGGC;下游引物N9UND-R:CCCAGTCGGTGTCGTTGTCTT
X液扩增的序列:
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