[发明专利]一种基于SSR与毛细管电泳技术鉴定甘蔗种质资源的方法无效
申请号: | 201410090829.5 | 申请日: | 2014-03-13 |
公开(公告)号: | CN104017859A | 公开(公告)日: | 2014-09-03 |
发明(设计)人: | 梁俊;刘守廷;甘志勇;莫璋红;宋雪萍;甘国勇 | 申请(专利权)人: | 南宁泰格瑞农业科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N27/447 |
代理公司: | 广西南宁明智专利商标代理有限责任公司 45106 | 代理人: | 黎明天 |
地址: | 530003 广西壮族自治区南宁市*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 ssr 毛细管 电泳 技术 鉴定 甘蔗 种质 资源 方法 | ||
1.一种高通量SSR甘蔗种质资源鉴定方法,其特征在于提取甘蔗新鲜嫩叶DNA后利用12对SSR荧光引物进行PCR扩增,然后将PCR产物经过毛细管电泳分析,构建出52个在中国广泛种植的甘蔗品种DNA指纹数据库,将待测品种或品系DNA指纹数据与已构建的甘蔗DNA指纹数据库中的数据进行对比分析,判断待测品种或品系的种类名称。
2.根据权利要求1所述的高通量SSR甘蔗种质资源鉴定方法方法,其特征在于,所述12对SSR荧光引物为筛选得到的核心引物,其中正向引物5'端以CY5磷荧光染料标记,合成荧光引物,并避光保存;引物信息如下:
引物名称:SMC7CUQ,条带大小:158-171Bp,引物退火温度:60℃,引物序列:
正向:5’-GCCAAAGCAAGGGTC ACT AGA-3’
反向:5’-AGCTCTATCAGTTGAAACCGA-3’;
引物名称:SMC18SA,条带大小:130-165Bp,引物退火温度:62℃,引物序列:
正向:5’-ATTCGGCTCGAC CTC GGG AT-3’
反向:5’-AGTCGAAAGGTAGCGTGGTGTTAC-3’;
引物名称:SMC22DUQ,条带大小:140-163Bp,引物退火温度:62℃,引物序列:
正向:5’-CCA TTC GAC GAA AGC GTC CT-3’
反向:5’-CAA GCG TTG TGC TGC CGA GT-3’;
引物名称:SMC24DUQ,条带大小:121-142Bp,引物退火温度:64℃,引物序列:
正向:5’-CGCAACGACATATACACTTCGG-3’
反向:5’-CGACATCACGGAGCA ATC AGT-3’;
引物名称:SMC31CUQ,条带大小:138-185Bp,引物退火温度:62℃,引物序列:
正向:5’-CATGCCAACTTCCAATACAGACT-3’
反向:5’-AGTGCCAATCCA TCT CAG AGA-3’;
引物名称:SMC36BUQ,条带大小:104-254Bp,引物退火温度:64℃,引物序列:
正向:5’-GGGTTTCAT CTC TAG CCT ACC-3’
反向:5’-TCAGTAGCAGAGTCAGACGCTT-3’;
引物名称:SMC119CG,条带大小:105-131Bp,引物退火温度:58℃,引物序列:
正向:5’-TTCATCTCT AGC CTA CCC CAA-3’
反向:5’-AGC AGC CAT TTA CCC AGG A-3’;
引物名称:SMC278CS,条带大小:140-182Bp, 引物退火温度:64℃,引物序列:
正向:5’-TTCTAGTGCCAATCCATCTCAGA-3’
反向:5’-CATGCCAACTTCCAAACAGACT-3’;
引物名称:SMC334BS,条带大小:132-165Bp, 引物退火温度:60℃,引物序列:
正向:5’-CAATTCTGACCG TGC AAA GAT-3’
反向:5’-CGATGAGCTTGA TTG CGA ATG-3’;
引物名称:SMC336BS,条带大小:141-185Bp, 引物退火温度:62℃,引物序列:
正向:5’-ATTCTAGTGCCAATCCATCTC A-3’
反向:5’-CATGCCAACTTC CAA ACA GAC-3’;
引物名称:SMC486CG,条带大小:224-245Bp, 引物退火温度:58℃,引物序列:
正向:5’-GAA ATT GCC TCC CAG GAT TA-3’
反向:5’-CCAACTTGAGAATTGAGATTCG-3’;
引物名称:SMC597CS,条带大小:144-179Bp, 引物退火温度:64℃,引物序列:
正向:5’-GCACACCACTCGAATAACGGAT-3’
反向:5’-AGTATATCGTCCCTGGCATTCA-3’。
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