[发明专利]一种胃液中lncRNA的提取与检测方法有效
申请号: | 201410088376.2 | 申请日: | 2014-03-11 |
公开(公告)号: | CN103834738A | 公开(公告)日: | 2014-06-04 |
发明(设计)人: | 郭俊明;邵永富;肖丙秀 | 申请(专利权)人: | 宁波大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;C12N15/10 |
代理公司: | 宁波诚源专利事务所有限公司 33102 | 代理人: | 徐雪波 |
地址: | 315211 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 胃液 lncrna 提取 检测 方法 | ||
1.一种胃液中lncRNA的提取与检测方法,包括如下步骤:
(1)采用RNA抽提试剂提取人胃液总RNA,用逆转录试剂对RNA提取液进行逆转录反应得到cDNA;
(2)对步骤(1)的cDNA溶液进行PCR扩增反应,再用荧光定量PCR仪检测扩增;
其特征在于:步骤(1)中采用抽提剂Trizol LS对胃液进行RNA的提取,并且在步骤(2)中通过lncRNA特异性扩增上下游引物或GAPDH扩增上下游引物对cDNA溶液进行PCR扩增反应。
2.如权利要求1所述的一种胃液中lncRNA的提取与检测方法,其特征在于:所述步骤(1)的具体步骤为:
a、胃液抽取:用胃管抽取空腹人胃液3~6ml,放入离心管中,室温下3000rpm离心3分钟,将上清转移到另一无RNA酶离心管中,至于冰上;
b、胃液预处理:取步骤a的胃液250~350μl置于2ml无RNA酶离心管中,加入3倍体积的Trizol LS试剂,漩涡振荡10秒,室温静置5分钟,4℃下,12000rpm离心10分钟,将上层液体转移到一新的无RNA酶离心管中;
c、三氯甲烷提取:在步骤b的上清液中加入0.2~0.3ml三氯甲烷,漩涡振荡10秒,室温下静置5分钟,4℃下,12000rpm离心15分钟,吸取上层水相移入新的无RNA酶离心管中;
d、异丙醇沉淀:加入与步骤c中上层水相等体积的异丙醇,混匀后,4℃条件下静置20分钟,然后4℃下12000rpm离心10分钟,弃上清得沉淀;
e、乙醇洗涤:在步骤d的沉淀中加入质量分数为75%的乙醇1ml,颠倒数次,4℃下12000rpm离心5分钟,弃上清;
f、干燥RNA:上一步弃上清后,再次4℃下12000rpm离心2分钟;弃上清,室温下干燥1~2分钟,加10μl无RNA酶水溶解,得到RNA提取液,-80℃保存备用;
g、RNA逆转录:用逆转录试剂对步骤f的RNA提取液进行逆转录反应得到cDNA溶液,置-20℃保存备用;
h、PCR检测:对步骤g的cDNA溶液进行PCR扩增反应,扩增上下游引物为lncRNA特异性扩增上下游引物或GAPDH扩增上下游引物,再用荧光定量PCR仪检测。
3.如权利要求1所述的一种胃液中lncRNA的提取与检测方法,其特征在于:所述步骤(2)中lncRNA特异性扩增上下游引物分别为RMRP扩增上下游引物。
4.如权利要求1所述的一种胃液中lncRNA的提取与检测方法,其特征在于:所述步骤(2)中lncRNA特异性扩增上下游引物分别为AA174084扩增上下游引物。
5.如权利要求1所述的一种胃液中lncRNA的提取与检测方法,其特征在于:所述步骤(2)中GAPDH特异性扩增上游引物为:5’ACCCACTCCTCCACCTTTGAC3’;和GAPDH特异性扩增下游引物为:5’TGTTGCTGTAGCCAAATTCGTT3’。
6.如权利要求3所述的一种胃液中lncRNA的提取与检测方法,其特征在于:所述RMRP扩增上游引物为:5’ACTCCAAAGTCCGCCAAGA3’;和RMRP扩增下游引物为:5’TGCGTAACTAGAGGGAGCTGAC3’。
7.如权利要求4所述的一种胃液中lncRNA的提取与检测方法,其特征在于:所述AA174084扩增上游引物为:5’CTGGTTCTTCATCCCTGCTATG3’;和AA174084扩增下游引物为:5’CCTGCTCCTCTTTGTGTTCTCT3’。
8.如权利要求1所述的一种胃液中lncRNA的提取与检测方法,其特征在于:所述步骤(2)的PCR扩增反应条件为:95℃预变性5分钟;然后94℃变性15秒,55℃退火30秒,70℃延伸30秒,共45个循环。
9.如权利要求1所述的一种胃液中lncRNA的提取与检测方法,其特征在于:所述步骤(1)中胃液与抽提剂Trizol LS的加入比例为1:2.5~3.5。
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