[发明专利]利用核糖体DNA序列构建核苷酸分子式鉴定植物品种的方法有效

专利信息
申请号: 201410022434.1 申请日: 2014-01-17
公开(公告)号: CN103757114A 公开(公告)日: 2014-04-30
发明(设计)人: 索志立;黄建民;侯伯鑫 申请(专利权)人: 中国科学院植物研究所;湖南省紫薇花木研究所
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 关畅
地址: 100093 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 利用 核糖体 dna 序列 构建 核苷酸 分子式 鉴定 植物 品种 方法
【权利要求书】:

1.一种鉴定或辅助鉴定待测紫薇品种的方法,包括如下步骤:

(1)以待测紫薇的基因组DNA为模板,用由序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA分子组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR产物;

(2)将所述PCR产物测序,根据测序结果列出所述待测紫薇的核苷酸分子式;

所述待测紫薇的核苷酸分子式的通式为:

B15B16B99B102B339B346B467

在所述通式中,所述B15、所述B16、所述B99、所述B102、所述B339、所述B346和所述B467,依次表示在所述PCR产物的核苷酸序列中,将所述PCR产物的核苷酸序列自5’端的第126个碱基记为第1个碱基,沿着所述PCR产物的核苷酸序列向3’端方向顺次计数的第15、16、99、102、339、346和467个碱基;

在所述通式中,每一个B为A、T、C和G四种碱基中的一种或两种的叠加;

(3)将步骤(2)所得所述待测紫薇的核苷酸分子式与核苷酸分子式组I进行比对;

所述核苷酸分子式组I由如下a1)-a10)共10种核苷酸分子式组成:

a1)G15C16T99T102T339A346G467

a2)G15C16Y99T102Y339A346G467

a3)G15C16Y99Y102Y339A346K467

a4)G15C16Y99T102Y339R346G467

a5)R15S16Y99W102Y339R346G467

a6)R15S16T99W102Y339R346G467

a7)G15C16T99W102Y339R346G467

a8)G15C16T99Y102Y339R346G467

a9)R15S16T99Y102Y339R346G467

a10)R15S16T99T102Y339R346G467

在a1)-a10)中,Y表示碱基T和C;K表示G和T;W表示碱基A和T;S表示C和G;R表示碱基A和G;

(4)根据步骤(3)的比对结果,按照如下方法对所述待测紫薇进行品种鉴定:

若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a1)所示的核苷酸分子式,则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘红环直枝紫’;

若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a2)所示的核苷酸分子式,则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘绿爪红蝶’;

若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a3)所示的核苷酸分子式,则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘白密香’;

若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a4)所示的核苷酸分子式,则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘黄药粉晶’;

若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a5)所示的核苷酸分子式,则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘皱瓣堇薇’;

若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a6)所示的核苷酸分子式,则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘建民红’;

若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a7)所示的核苷酸分子式,则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘直萼红爪粉’;

若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a8)所示的核苷酸分子式,则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘宝庆紫’;

若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a9)所示的核苷酸分子式,则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘长爪珊瑚堇薇’;

若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a10)所示的核苷酸分子式,则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘大花翠盘堇薇’。

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