[发明专利]一种α-地中海贫血荧光定量PCR检测试剂盒及其应用有效
申请号: | 201410017845.1 | 申请日: | 2014-01-15 |
公开(公告)号: | CN103757111A | 公开(公告)日: | 2014-04-30 |
发明(设计)人: | 戴立忠;付亚成;邓中平 | 申请(专利权)人: | 湖南圣维尔医学检验所有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京聿宏知识产权代理有限公司 11372 | 代理人: | 吴大建;欧颖 |
地址: | 410012 湖南省长*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 地中海贫血 荧光 定量 pcr 检测 试剂盒 及其 应用 | ||
1.一种α-地中海贫血荧光定量PCR检测试剂盒,其包括3种PCR反应液,所述3种PCR反应液中均含有用于靶多核苷酸扩增的引物,其中,
PCR反应液Ⅰ:含有源于人基因组16号染色体α1和α2基因的保守区域的用于检测α-地中海贫血SEA缺失的引物,且所述引物的序列为,
上游引物α-SEA-F:5’-TCAGCCACCCGCAGACCAAGACCTA-3’;
下游引物α-SEA-R:5’-AGACAGCGTCACCCTCAGAGCCAT-3’
PCR反应液Ⅱ:含有源于人基因组16号染色体α1基因的保守区域的用于检测α-地中海贫血3.7缺失的引物,且所述引物的序列为,
上游引物α-3.7-F:5’-GGGGTGTCACAGTGAACCACGACC-3’;
下游引物α-3.7-R:5’-GCCCCTGCCTTTTCCTACCCTATCC-3’;
PCR反应液Ⅲ:含有源于人基因组16号染色体α2基因的保守区域的用于检测α-地中海贫血4.2缺失的引物,且所述引物的序列为,
上游引物α-4.2-F:5’-GGCAGCCTTGGGCAACCTGTCTAC-3’;
下游引物α-4.2-R:5’-GGGCGGCTCCAGATTCAGACTCCT-3’。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述3种PCR反应液中均含有SYBR GREEN染料、PCR反应缓冲液、脱氧核糖核苷三磷酸、脱氧尿嘧啶核苷三磷酸及参比染料。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,每种所述PCR反应液中含SYBR GREEN I染料、10×PCR反应缓冲液、0.1~0.4mmol/L脱氧核糖核苷三磷酸、0.1~0.4mmol/L脱氧尿嘧啶核苷三磷酸、40~200mmol/L参比染料以及0.2μmol/L~0.4μmol/L用于靶多核苷酸扩增的上下游引物。
4.根据权利要求1~3中任意一项所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括酶混合液和α-地中海贫血阴性对照。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述酶混合液包含浓度为1~5U/μl的耐热DNA聚合酶和浓度为0.05~0.2U/μl的尿嘧啶DNA糖基化酶。
6.根据权利要求1~5中任意一项所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括裂解液、蛋白酶K溶液、吸附柱、漂洗液、缓冲液Ⅰ、缓冲液Ⅱ、缓冲液Ⅲ。
7.一种使用如权利要求1~6中任意一项所述的试剂盒进行α-地中海贫血荧光定量PCR检测的方法,其包括:
步骤K,将3种PCR反应液分别与酶混合液混合后制成3种PCR混合液;
步骤L,将3种PCR混合液离心处理,然后将经过离心处理的3种PCR混合液分别加入3组反应管,并分别向含有PCR混合液的各反应管中加入α-地中海贫血阴性对照和待测样品核酸,制成PCR反应样品,盖好管盖;
步骤M,将各反应管置于荧光定量PCR扩增仪上进行荧光PCR反应,检测并记录样品的扩增曲线与阈值线;
步骤N,根据样品的扩增曲线形状、扩增曲线与阈值线是否存在交点Ct,以及Ct值进行α-地中海贫血缺失分析;
其中,在步骤K中,PCR反应液的加入量为42~43μl/人份,酶混合液的加入量为1~2μl/人份。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,在步骤L中,每个反应管中总液体加入量为50μl,待测样本核酸或α-地中海贫血阴性对照的加入量为3~5μl。
9.根据权利要求7或8所述的方法,其特征在于,在步骤N中,如果样本扩增曲线呈S型,有Ct值,且Ct值≥36,可以判为阳性;如果样本扩增曲线平直,无Ct值显示或无定值结果显示,则判为阴性。
10.根据权利要求7或8所述的方法,其特征在于,所述方法还包括提取核酸的操作,其包括,
步骤A,裂解红细胞及蛋白;
步骤B,去除杂质;
步骤C,洗涤;
步骤D,洗脱。
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