[发明专利]分离循环肿瘤细胞的方法

说明书

提供用于测定或分离受试者的循环肿瘤细胞(CTC)的方法。所述方法可包括检测至少一种上皮间充质转化(EMT)生物标志物的表达。还提供用于测定或分离CTC的试剂盒。该试剂盒可包括至少一种EMT生物标志物的抗体。还提供预测受试者对癌症药物的响应性的方法、受试者中癌症药物靶向递送的方法，提供受试者的癌症预后的方法和用于跟踪受试者的癌症进展的方法。

相关申请的交叉引用

本申请要求2013年2月2日提交的美国临时申请号61/760,042和2013年3月28日提交的美国临时申请号61/806,358的优先权，其通过引用以其整体结合到本文中。

有关联邦政府资助研究的声明

在美国国防部授予的联邦资助号W81XWH-10-1-0483和NIH授予的联邦资助号5R01-CA127727-03的政府支持下完成本发明。美国政府对本发明享有一定权利。

序列表

序列表仅以电子格式随本申请一起提交，并通过引用结合到本文中。序列表文本文件“WO00_ASFILED_SequenceListing-Text”创建于2013年5月31日，大小为131,252字节。

发明领域

本公开内容涉及用于癌症检测和预后的方法。而且，本公开内容提供用于俘获和分离循环肿瘤细胞(CTC)的方法，所述方法包括可用于与受试者的癌症的预后、诊断或治疗有关的方法的CTC的鉴定、检测和任选计数。

发明背景

可根据形态学、行为和分子特征，将大多数后生动物细胞分为上皮的或间充质的。通过表型转换(一种称为上皮可塑性的过程)，上皮肿瘤细胞可变成间充质细胞，反之亦然。上皮细胞在顶端-基底方向通常是极性的，与在与极性垂直的平面上的相邻细胞附着在一起，并且在极性方向上是不动的。相比之下，间充质细胞没有极性，不与邻接细胞形成紧密的相互作用，并且是能动的。在成年动物中，上皮细胞和间充质细胞在一种状态或另一种状态下保持稳定；也就是说，上皮细胞不改变其性质和变成间充质细胞。然而，在发育期间，早期胚胎的上皮细胞产生所有3种胚层(内胚层、中胚层和外胚层)，其包括间充质细胞(Hay,E.D.等, Am. J. Kidney Dis. 1995, 26, 678-690)。因此，这些早期胚细胞具有在上皮和间充质状态间转化的能力。胚胎显示进行上皮-间充质转化(EMT)以及间充质-上皮转化(MET) (Acloque, H.等, J. Clin. Invest.2009, 119, 1438-1449)。

上皮可塑性(EP)是指上皮细胞表型的可逆丧失，一种已知在癌转移期间发生的过程。在多项研究中该EP生物学与癌症转移风险和在EMT过程中间充质和/或干细胞性(stemness)性质的获得有关。EMT在癌症的多个临床前模型中与化学抗性、侵袭、内渗和扩散有关。导致上皮表型重新表达的MET过程，在发育和转移中也可能具有重大意义，并且在转移生态位中与肿瘤细胞的转移定居和存活有关。例如，在前列腺癌中，间充质生物标志物在前列腺癌细胞系、动物模型和患者肿瘤样本中在雄激素剥夺期间可上调。而且，这些生物标志物在睾酮替代时是可塑性恢复的，并且与转移倾向和化学抗性提高有关。间充质样肿瘤细胞可更好地促进局部肿瘤侵袭和内渗/外渗，但是上皮肿瘤细胞在转移生态位中对于最终的存活和增殖可能是必需的，说明了EP的双重性质在介导整个转移过程中的潜在关联性。