[发明专利]多重核酸检测方法

权利要求书

1.一种通过多重连接依赖性探针扩增在单次运行中查询多个不同靶核酸的体外、非诊断性的且非治疗性的方法，其包括：

(a)提供样品组织以查询至少100个不同靶核酸，其中所述靶核酸是基因组DNA；

(b)针对所述至少100个不同靶核酸中的每一个提供多个不同的探针组，其中每个探针组包含：

第一基因座特异性探针，其由第一接头序列和第一靶特异性部分组成；和

第二基因座特异性探针，其由第二接头序列和邻近所述第一靶特异性部分的第二靶特异性部分组成；

(c)将所述多个不同探针组与所述至少100个不同靶序列杂交以形成至少100个杂交复合体；

(d)连接所述至少100个杂交复合体以形成至少100个不同的连接的探针；

(e)扩增所述至少100个不同的连接的探针以形成至少100个不同扩增子，其中所述扩增步骤使用第一通用引物和第二通用引物进行，所述第一通用引物包含与所述第一接头序列互补的区域，所述第二通用引物包含与所述第二接头序列互补的区域；和

(f)通过对所述至少100个不同扩增子的每一个进行测序在检测系统中与长度无关地检测所述至少100个不同扩增子，

其中所述至少100个不同靶核酸在100到1000个靶核酸的范围内。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述至少100个不同靶核酸在100到500个靶核酸的范围内。

3.根据权利要求1所述的方法，其中所述检测系统包括合成测序。

4.根据权利要求3所述的方法，其中所述检测系统包括配置在包含所述至少100个不同扩增子的阵列上进行合成测序循环的流体处理系统，所述检测系统被配置为将辐射从源引导至所述阵列并将荧光发射从所述阵列引导至照相机，和配置为自动改变所述检测系统以增加引导至所述阵列的所述辐射的暴露水平和在所述增加的暴露下检测从所述阵列到所述照相机的荧光发射的系统控制界面。

5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法，其还包括测定所述至少100个不同扩增子的序列。