[发明专利]通过单链扩增和测序对单个细胞进行精确基因组测序有效
申请号: | 201380055254.7 | 申请日: | 2013-09-10 |
公开(公告)号: | CN104797718B | 公开(公告)日: | 2020-05-08 |
发明(设计)人: | 张鹍;黄晓华 | 申请(专利权)人: | 加利福尼亚大学董事会 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12M1/38 |
代理公司: | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 | 代理人: | 王达佐;洪欣 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 通过 扩增 单个 细胞 进行 精确 基因组 | ||
1.用于对单个细胞的基因组核酸进行测序的方法,所述方法包括:
分离单个细胞的染色体的多个双链核酸,其中所述多个中每个双链核酸包含核酸第一链和核酸第二链,并且其中所述核酸第一链和核酸第二链彼此互补;以及
将所述多个双链核酸的第一链和第二链置于多个溶液中,其包括:
使所述双链核酸变性,从而在溶液中将所述核酸的第一单链与互补的第二单链分开;和
将所述溶液中变性的第一单链和第二单链分配在不同溶液中,所述分配包括机械旋转或被动扩散,
其中所述多个溶液中的每一溶液彼此分开,并且
其中所述多个溶液中的每一溶液包含类似数量的单链,并且
其中同一双链核酸的第一链和第二链在分开的溶液中的可能性为至少95%,并且其中所述可能性取决于所述单个细胞的不同双链核酸的数量;以及
对每条链进行测序。
2.权利要求1所述的方法,其中所述分配包括机械旋转。
3.权利要求1所述的方法,其中所述分配包括被动扩散。
4.权利要求1所述的方法,还包括扩增每条链。
5.权利要求4所述的方法,其中在测序之前将每条链在所述多个溶液之一中进行扩增。
6.权利要求4所述的方法,其中每条链由多链置换扩增进行扩增。
7.权利要求4所述的方法,其中每条链被扩增至不超过10,000倍的幅度。
8.权利要求4所述的方法,其中每条链被扩增至不超过1000倍的幅度。
9.权利要求1所述的方法,其中所述双链核酸包含染色体片段的双链核酸。
10.权利要求1-9任一项所述的方法,其中所述多个溶液中每一个具有10nl或更少的体积。
11.权利要求1-9任一项所述的方法,其中所述多个溶液中每一个具有4nl或更少的体积。
12.权利要求1-9任一项所述的方法,其中所述多个溶液中每一个具有2nl或更少的体积。
13.权利要求1-9任一项所述的方法,其中所述多个溶液中每一个具有1nl或更少的体积。
14.权利要求1-9任一项所述的方法,其中所述多个溶液中每一个具有0.4nl或更少的体积。
15.权利要求1-9任一项所述的方法,其中对每条链进行测序包括扩增核酸不超过24小时。
16.权利要求1-9任一项所述的方法,其中对每条链进行测序包括扩增核酸不超过10小时。
17.权利要求1-9任一项所述的方法,其中对每条链进行测序包括扩增核酸不超过5小时。
18.权利要求1-9任一项所述的方法,其中测序包含小于1010个中1个的错误率。
19.权利要求1-9任一项所述的方法,其中测序包含小于1012个中1个的错误率。
20.权利要求1-9任一项所述的方法,其中所述多个溶液包含至少24个溶液。
21.权利要求1-9任一项所述的方法,其中所述多个溶液被放置于微流控装置中。
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