[发明专利]核酸分类无效

专利信息
申请号: 201380044139.X 申请日: 2013-08-16
公开(公告)号: CN104685069A 公开(公告)日: 2015-06-03
发明(设计)人: 大卫·劳伦斯·梅丁;谢尔伍德·拉斯·来尔曼 申请(专利权)人: 拜奥-奈穆斯公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 北京律盟知识产权代理有限责任公司 11287 代理人: 张世俊
地址: 美国加利*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 核酸 分类
【权利要求书】:

1.一种用于对靶核酸分类的方法,所述方法包含:

在测试系统中,使一或多个捕获探针暴露于所述靶核酸,所述一或多个捕获探针附接到表面;

在所述测试系统中建立第一杂交条件;

确定所述一或多个捕获探针与所述靶核酸在所述第一杂交条件下的第一杂交程度;

在所述测试系统中建立第二杂交条件;

测定所述一或多个捕获探针与所述靶核酸在所述第二杂交条件下的第二杂交程度;以及

通过比较所述第一杂交程度与所述第二杂交程度来对所述靶核酸分类。

2.根据权利要求1所述的方法,其中:

所述测试系统在所述表面上包含一或多个传感器,其经配置以测量所述一或多个捕获探针与所述靶核酸的杂交。

3.根据权利要求2所述的方法,其中:

所述传感器为谐振器阵列,其经配置以测量在所述谐振器阵列的至少一个表面上的目标的质量;

所述一或多个捕获探针附接到所述谐振器系统的所述表面;并且

测定所述一或多个捕获探针与所述靶核酸的所述第一杂交程度和所述第二杂交程度包含测量在所述谐振器阵列的所述表面上的所述质量。

4.根据权利要求1所述的方法,其中:

使所述一或多个捕获探针暴露于所述靶核酸包含使所述一或多个捕获探针与含有所述靶核酸的溶液接触;

建立所述第一杂交条件包含将所述溶液的温度调整到第一温度;以及

建立所述第二杂交条件包含将所述溶液的温度调整到第二温度。

5.根据权利要求1所述的方法,其中所述第一杂交条件经选择以使靶核酸与所述一或多个捕获探针之间的杂交减到最少,并且其中所述第二杂交条件经选择以促进所述靶核酸与所述一或多个捕获探针之间的杂交。

6.根据权利要求1所述的方法,其中对所述靶核酸分类包含:

渐进地调整所述测试系统的一或多个杂交条件以促进靶核酸与所述一或多个捕获探针之间的杂交;

在每次调整之后,测定所述一或多个捕获探针与所述靶核酸的杂交程度;以及

继续调整所述杂交条件,直至所述杂交程度达到阈值杂交程度。

7.根据权利要求1所述的方法,其中所述测试系统包含在第一位置处的一或多个第一捕获探针及在第二位置处的一或多个第二捕获探针,并且其中对所述靶核酸分类包含:

渐进地调整所述测试系统的一或多个杂交条件;

在每次调整之后,测定所述第一位置和所述第二位置各自对应的杂交程度;以及

确定在所述第一位置处的杂交程度是在所述第二位置处的杂交程度达到阈值杂交程度之前还是之后达到所述阈值杂交程度。

8.根据权利要求1所述的方法,其进一步包含:在使所述一或多个捕获探针暴露于所述靶核酸之前校准所述测试系统,其包括:

将一或多个双链核酸捕获探针附接到所述测试系统的表面;

使所述一或多个双链核酸捕获探针与溶液接触;

渐进地调整所述测试系统的一或多个杂交条件,直至达到所述双链核酸捕获探针的解离程度,以使得所述溶液含有单链核酸并且单链核酸捕获探针保留在所述表面上;记录达到第一双链核酸捕获探针的解离程度、从而产生单链核酸的所述一或多个杂交条件;以及

从所述测试系统去除所述单链核酸。

9.根据权利要求8所述的方法,其进一步包含:在使所述一或多个捕获探针暴露于所述靶核酸之前,校准所述测试系统,其包括:

测量附接到所述测试系统的所述表面的第一组核酸捕获探针;

渐进地调整所述测试系统的所述一或多个杂交条件,直至达到所述记录的杂交条件;

测量附接到所述测试系统的所述表面的第二组核酸捕获探针;以及

基于所述第一组核酸捕获探针和所述第二组核酸捕获探针测定所述单链核酸捕获探针的变化。

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