[发明专利]一种确定RNA完整性的方法在审

专利信息
申请号: 201380029890.2 申请日: 2013-04-23
公开(公告)号: CN104769130A 公开(公告)日: 2015-07-08
发明(设计)人: 亚历山大·艾伦·莫利;迈克尔·朱利安·布里斯科 申请(专利权)人: 莫诺夸特有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 代理人: 郑斌;彭鲲鹏
地址: 澳大利亚南*** 国省代码: 澳大利亚;AU
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摘要:
搜索关键词: 一种 确定 rna 完整性 方法
【权利要求书】:

1.一种确定样品中RNA完整性之定量测量值的方法,所述方法包括:

(i)测定含从参考基因转录之RNA分子实体的样品,其中至少一些所述实体是损坏的,以确定所述样品中所述RNA分子的多种片段中每种片段之完整实体的相对或绝对数目的定量测量值,所述片段具有各自不同的长度;以及

(ii)基于所确定的定量测量值和所述片段的各自不同长度之间的关系,确定所述样品中所述RNA分子实体之完整性的定量测量值。

2.权利要求1所述的方法,其还包括:

(iii)对目的RNA进行定量并且使用在步骤(ii)中计算出的完整性的测量值以及目的RNA相应的降解相关片段(或其衍生物)的长度来校正该结果。

3.权利要求1所述的方法,其还包括:

(iii)对从标准基因转录之目的基因转录的RNA进行定量并且使用在步骤(ii)中确定的完整性的测量值以及目的RNA相应的降解相关片段(或其衍生物)的长度来校正该结果。

4.权利要求1至3中任一项所述的方法,其中所述对样品中RNA的定量是相对于标准RNA的定量进行的,其中所述样品中相对于标准RNA分子的量的RNA分子的量由下式给出:

Ntest/Nstan=(Stest/Sstan)·e(Ltest·rtest-Lstan·rstan)]]>

其中Ntest/Nstan是目的RNA分子(测试分子)的量与标准RNA分子的量的比,Stest/Sstan是所述样品中各测试片段与标准片段所测得的量的比,Ltest和Lstan是测试降解相关片段(或其衍生物)和标准降解相关片段(或其衍生物)各自的长度,以及rtest和rstan是测试RNA分子实体和标准RNA分子实体在包含它们的样品中之每个核苷酸的平均损伤数r。

5.权利要求1至4中任一项所述的方法,其中所述样品中所述RNA分子实体的数目(N)、所述样品中所述RNA分子的多种片段中每种片段之完整实体i的相对或绝对数目的定量测量值(Ni)、所述片段的长度(Li)以及所述RNA分子的实体中每个核苷酸的平均损伤数(r)之间的关系由下式给出:

Ni=N·e-Lir.]]>

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