[发明专利]用于疾病治疗的嵌合蛋白

说明书

背景技术

本申请要求2012年3月12日提交的、申请号为No.61/609,523美国临时专利申请的优先权。其公开的全部内容以引用的形式并入本申请。

本申请包括于2013年3月12日创建的序列表，该文件为ASCII格式，名称为“SCAR200003_ST25.txt”，大小为123,236字节。该文件的全部内容以引用的方式并入本申请。

本发明涉及与重组嵌合蛋白的产生和使用相关的方法、材料、组合物、应用以及治疗，这种重组嵌合蛋白在本文中可以被称为混杂清道夫受体。

脓毒症通常被定义为病理感染和生理变化的组合，统称为全身炎症反应综合征(SIRS)。相关术语败血症是指血液中存在病原微生物，会导致脓毒症。在本文中这两个术语通常互换使用。

脓毒症的死亡率很高，据报道，尽管经过抗生素的治疗，在受严重影响的患者中仍有20％至50％的死亡率。脓毒症是非冠脉重症监护病房(“ICU”)患者的第二大死亡原因，还是美国的第十大死亡原因，欧洲的数据与此类似。此外，脓毒症是幼年个体死亡的主要原因，并且对于幸存的人来说其终生的生活质量也降低了。目前脓毒症的治疗主要包括广谱抗生素和器官支持治疗，并且往往是无效的。随着病原体之间抗生素抗性的增加，治疗的功效则会减少。

尽管整体住院死亡率下降，在过去22年中脓血症的发病率已经大幅上升并且死亡数目仍在增长。根据医院的出院记录，使用ICD-9编码创建了美国的脓毒症记录，并且据估计，每年超过751,000例重症脓毒症发生，占住院的2.1％至4.3％和所有接诊的重症监护病房的11％。据估计，在过去的20年里，脓毒症在美国的发生率已经显著地增加。发病率增加的可能原因包括侵入性操作应用的增加，免疫抑制药物、化疗和移植，人类免疫缺陷病毒(HIV)感染疫情的出现，以及微生物抗性的增加。随着时间的推移，具体的致病微生物的相对频数发生了转变，最近革兰氏阳性菌特别明显。令人担忧的是，脓毒症导致的器官衰竭越来越多，并且成为死亡的主要原因。在欧洲可能有类似的情况。

发明内容

本文公开了可用于与病原体结合的多种嵌合蛋白。简单地说，每种蛋白包含来源自哺乳动物清道夫受体的病原体识别模块。每种蛋白还包含用于将所述嵌合蛋白固定在适当位置的锚定域。

本文在各种实施方案中公开的重组嵌合蛋白包含：来自哺乳动物清道夫受体的病原体识别模块、和锚定域。

该蛋白还可包含介于所述病原体识别模块和所述锚定域之间的连接体。该连接体可以为约2至约5个氨基酸的序列。该连接体可以包含至少两种不同的氨基酸。在一些实施方案中，这两种不同的氨基酸选自由丙氨酸、组氨酸和甘氨酸组成的组。

该蛋白质还可包含亲和标记。亲和标记可以选自由血凝素、V5、Myc、T7、FLAG、HSV、VSV-G、6-His、生物素/链霉亲和素和STREP所组成的组。

所述病原体识别模块可以为病原体结合域，其来自哺乳动物细胞表面受体家族，例如SCARA3、CD36、CD163、CD68、LOX-1、SREC-1或SCARA5。这些清道夫受体含有病原体结合域，例如保守SRCR结构域，C型凝集素样结构域(CTLD)，或胶原序列。

所述锚定域可以是免疫球蛋白的Fc段。可替代地，所述锚定域可以是来自哺乳动物清道夫受体的α-螺旋卷曲螺旋域(α-helical coiled coil domain)。所述锚定域也可以是亲和标记。在本发明的特定实施方案中，获得病原体识别模块的哺乳动物清道夫受体与获得锚定域的哺乳动物清道夫受体不同。

该蛋白还可包含信号肽。

本文还公开了编码所述嵌合受体蛋白的核酸序列、包含该核酸序列的载体、以及包含该载体的宿主细胞。

本文还公开了一种含有嵌合蛋白和药学上可接受的载体的药物组合物，其中所述嵌合蛋白包含来自清道夫受体的病原体识别模块、和锚定域。

本文还公开了一种含有固相和固定在该固相上的嵌合蛋白的亲和介质，其中，所述嵌合蛋白包含来自清道夫受体的病原体识别模块、任选的连接体、和锚定域，所述锚定域附着在所述固相上。

此外，本发明描述了一种选择性地再生所公开的亲和介质的方法，其中通过对所述介质进行处理，从而使所结合的病原体或病原体衍生分子脱落，同时使固相之间的连接以及嵌合蛋白与固相之间的连接保持原状。