[发明专利]一种凡纳对虾SWD基因亚型Lv-SWDi、其编码的氨基酸序列以及克隆方法无效
申请号: | 201310733006.5 | 申请日: | 2013-12-27 |
公开(公告)号: | CN103981188A | 公开(公告)日: | 2014-08-13 |
发明(设计)人: | 杜志强;林涛;吴烨 | 申请(专利权)人: | 内蒙古科技大学 |
主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C12N15/10;C07K14/435 |
代理公司: | 包头市专利事务所 15101 | 代理人: | 庄英菊 |
地址: | 014010 内蒙*** | 国省代码: | 内蒙古;15 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 对虾 swd 基因 lv swdi 编码 氨基酸 序列 以及 克隆 方法 | ||
1.一种凡纳对虾SWD基因亚型Lv-SWDi,其特征在于,其核苷酸序列为SEQ ID NO.1。
2.根据权利要求1所述的一种凡纳对虾SWD基因亚型Lv-SWDi,其特征在于,凡纳对虾SWD基因亚型Lv-SWDi编码的蛋白质对应的氨基酸序列为SEQ ID NO.2。
3.一种凡纳对虾SWD基因亚型Lv-SWDi的克隆方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)选用凡纳对虾作为实验材料,利用动物总RNA提取试剂盒提取多种组织的总RNA,获得凡纳对虾各种组织的总RNA样品;
(2)以步骤(1)获得的总RNA样品作为模板,利用一步法RT-PCR扩增试剂盒进行cDNA的反转录合成,获得凡纳对虾各个组织的cDNA样品;
(3)设计扩增凡纳对虾SWD基因亚型Lv-SWDi编码区的前后引物Lv-SWDi-F和Lv-SWDi-R:
Lv-SWDi-F:5′-TACTCAGAATTCATGGTGTCCATCAAGGCAGTTC-3′
Lv-SWDi-R:5′-TACTCACTCGAGTTACCTTCCACTTCCGTAAG-3′
以步骤(2)中的凡纳对虾的各个组织的cDNA样品作为模板,以Lv-SWDi-F和Lv-SWDi-R作为扩增反应的引物对,进行PCR扩增反应,反应的程序为:94℃预变性5min,94℃变性30s,58℃退火30s,72℃延伸30s,循环35圈,后延伸5min,获得PCR反应产物;
(4)将步骤(3)获得的PCR反应产物进行回收、纯化,之后进行EcoRⅠ核酸内切酶和XhoⅠ核酸内切酶的双酶切处理,并且与经过EcoRⅠ核酸内切酶和XhoⅠ核酸内切酶双酶切处理的大肠杆菌pET-28a质粒载体连接,转化大肠杆菌DH5α克隆菌株感受态细胞之后,进行菌落PCR筛选,将筛选得到的阳性克隆子送测序公司进行序列测定,获得凡纳对虾SWD基因亚型Lv-SWDi的基因序列。
(5)将步骤(4)获得的基因序列,利用分子生物学翻译软件进行氨基酸序列的翻译,获得对应蛋白质的氨基酸序列。
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