[发明专利]检测鸡三种免疫抑制病病毒的基因芯片及试剂盒与方法有效
申请号: | 201310728530.3 | 申请日: | 2013-12-25 |
公开(公告)号: | CN103667538A | 公开(公告)日: | 2014-03-26 |
发明(设计)人: | 杨兵;苏霞;陈小玲;徐福州;周宏专;王金洛;朱瑞豪;杨丽聪 | 申请(专利权)人: | 北京市农林科学院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C40B40/06;C12R1/93 |
代理公司: | 北京海虹嘉诚知识产权代理有限公司 11129 | 代理人: | 吴泳历 |
地址: | 100097 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 鸡三种 免疫抑制 病毒 基因芯片 试剂盒 方法 | ||
1.一种检测鸡三种免疫抑制病病毒的基因芯片,其特征在于:在芯片基质上设置有鸡淋巴白血病病毒ALV的四个亚群A亚群、C亚群、D亚群和J亚群、鸡传染性贫血病毒CAV、禽网状内皮增生症病毒REV的特异性探针序列,所述特异性探针序列如下:
鸡淋巴白血病病毒A亚群(A1),TTTTTTTGTCTCAGGGGGAGGCCACACGGTTTCTC;
鸡淋巴白血病病毒A亚群(A2),TTTTGGTTGGTCTAGACAGGAGGCCACGCGGTTTC;
鸡淋巴白血病病毒A亚群(A3),TTTTGGATGGACTAGACAGGAAGCCACACGGTTCC;
鸡淋巴白血病病毒A亚群(A4),TTTTTGCTTTCAGATTGGTCCAGGCCGCAACTCAC;
鸡淋巴白血病病毒C亚群(C1),TTTTGGATGTGTATATTTCGCCCCAAGGGCCACTG;
鸡淋巴白血病病毒D亚群(D1),TTTTTTTTGGCCGGGAAGAGGTGACACACATCCTC;
鸡淋巴白血病病毒C亚群(J3),TTCTTAGTCTACAGTCAGCGACCTCGCCATTCCGC;
鸡淋巴白血病病毒C亚群(J4),CTTAGTCTACAGTCAGCTACCTCTCCCTTCCGCAC;
鸡传染性贫血病病毒(CAV),TTTTTTTTTGGGCAGTGAATCGGCGCTTAGCCG;
网状内皮增生症病毒(REV),TTTTTTTTTCTTGCTCGGGGTCGCCGTCCTACA。
2.一种检测鸡三种免疫抑制病病毒的基因芯片试剂盒,其特征在于包括如下组件:
(1)权利要求1所述的基因芯片;
(2)七条引物:
鸡淋巴白血病病毒ALV的A、C、D、J四个亚群通用上游引物J-U:
5’-GGATGAGGTGACTAAGAAAG-3’;
J亚群下游引物J-L:5’-CGAACCAAAGGTAACACACG-3;
A、C和D亚群通用下游引物Tong:5'-CTGTAGCCATATGCACC-3';
CAV上游引物C-U:5’-ACATACCGGTCGGCAGTAGG-3’;
CAV下游引物C-L:5’-AGCTCGCTTACCCTGTACTC-3’;
REV上游引物R-U:5’-CTACGGATTCAGTCCGGATC-3’;
REV下游引物R-L:5’-CATACTGAGCCAATGGTTGTA-3’;
且J-L、Tong、C-L与R-L的5’端有Cy3荧光标记。
3.根据权利要求2所述的基因芯片试剂盒,还包括除通用引物和DNA探针之外的PCR扩增所需试剂、杂交液、芯片洗液。
4.根据权利要求3所述的基因芯片试剂盒,所述杂交液的成分为:3×SSC溶液,25%甲酰胺,0.2%SDS,5×Denhardt溶液。
5.根据权利要求3所述的基因芯片试剂盒,所述芯片洗液包括洗液A和洗液B;洗液A的配方为2×SSC,0.2%SDS;洗液B为0.2×SSC。
6.根据权利要求2所述的基因芯片试剂盒,还包括PCR阴性对照模板和阳性对照模板,所述阴性对照模板为双蒸水,所述阳性对照模板为CAV参考毒株CUX的质粒DNA。
7.根据权利要求2~6任一所述的基因芯片试剂盒,所述七条引物混合存放在两个引物管中,;两个引物管中的引物及其混合浓度比例为:J-U:J-L:Tong=5:2:3;(C-U+C-L):(R-U+R-L)=1:3。
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