[发明专利]大豆北方茎溃疡病菌的检测靶标及其LAMP引物组合物和应用有效
| 申请号: | 201310683495.8 | 申请日: | 2013-12-13 |
| 公开(公告)号: | CN103695542A | 公开(公告)日: | 2014-04-02 |
| 发明(设计)人: | 郑小波;沈浩;戴婷婷;王源超;张海峰 | 申请(专利权)人: | 南京农业大学 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
| 代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 傅婷婷;徐冬涛 |
| 地址: | 211225 江苏省南京市溧*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 大豆 北方 溃疡 病菌 检测 靶标 及其 lamp 引物 组合 应用 | ||
1.大豆北方茎溃疡病菌的检测靶标序列Tef,其特征在于核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
2.SEQ ID NO.1所示的大豆北方茎溃疡病菌的检测靶标序列Tef在检测或鉴定大豆北方茎溃疡病菌中的应用。
3.针对权利要求1所述的大豆北方茎溃疡病菌的检测靶标序列Tef设计的特异性的LAMP引物组合物,其特征在于正向内引物FIP如SEQ ID NO.2所示,反向内引物BIP如SEQ ID NO.3所示,正向外引物F3如SEQ ID NO.4所示,反向外引物B3如SEQ ID NO.5所示。
4.根据权利要求3所述的特异性的LAMP引物组合物,其特征在于还包含正向环引物LF如SEQ ID NO.6所示,反向环引物LB如SEQ ID NO.7所示。
5.权利要求3或4所述的针对权利要求1所述的LAMP引物组合物在制备检测或鉴定大豆北方茎溃疡病菌的试剂中的应用。
6.一种用于检测大豆北方茎溃疡病菌的LAMP检测试剂盒,其特征在于包含权利要求3或4所述的特异性的LAMP引物组合物。
7.根据权利要求5所述的用于检测大豆北方茎溃疡病菌的LAMP检测试剂盒,其特征在于所述的试剂盒包含:由20mM正向内引物FIP、20mM反向内引物BIP,10mM正向外引物F3、10mM反向外引物B3,10mM正向环引物LF、10mM反向环引物LR,9.26%10xThermoPol Reaction Buffer、50mM MgSO4、10mM dNTP Mixture、5M甜菜碱、8000U/mL Bst DNA Polymerase Large fragment及超纯水组成的检测溶液。
8.一种检测大豆北方茎溃疡病菌的方法,其特征在于提取待检微生物的DNA,以提取的DNA为模板,利用权利要求3或4所述的特异性的LAMP引物组合物进行LAMP扩增反应;扩增产物加入SYBR GREENⅠ染料,在常光和/或紫外光下检测,如果反应产物在常光下变显黄色、在紫外光下产生强烈荧光,则表示存在大豆北方茎溃疡病菌;如果反应产物在常光下显橙色、紫外光下无荧光产生则表示不含该病菌。
9.根据权利要求8所述的检测大豆北方茎溃疡病菌的方法,其特征在于提取待检微生物的DNA,取3μl DNA溶液,加入21.5μl权利要求7所述的检测溶液和2.5μl灭菌去离子水进行LAMP反应,反应程序为:64℃70min;增产物加入SYBR GREEN Ⅰ染料,在紫外光下检测结果,如果反应产物产生强烈荧光,则表示存在大豆北方茎溃疡病菌,无荧光产生则表示不含该病菌。
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