[发明专利]用于检测菊黄东方鲀生长速度的引物对及方法有效
申请号: | 201310654636.3 | 申请日: | 2013-12-05 |
公开(公告)号: | CN103805694A | 公开(公告)日: | 2014-05-21 |
发明(设计)人: | 张之文;施永海;张根玉;张海明;张中华;徐嘉波;邓平平 | 申请(专利权)人: | 上海市水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 上海三方专利事务所 31127 | 代理人: | 吴干权 |
地址: | 200433 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 东方 生长 速度 引物 方法 | ||
[技术领域]
本发明涉及菊黄东方鲀的检测引物和方法,具体涉及检测菊黄东方鲀生长速度的引物对及方法。
[背景技术]
菊黄东方鲀(Fugu flavidus)俗称艇巴、乖鱼、菊黄、满天星等,分类上隶属鲀形目(Tetraodontif-ormes)鲀科(Tetraodontidae)东方鲀属(Fugu),主要分布于我国黄海、东海和渤海。由于其味道鲜美,营养丰富,颇受欢迎,是一种名贵的养殖种类。在养殖过程中,生长速度快的个体可以缩短养殖时间,提高饲料的利用率,节约养殖成本,因此培育筛选生长速度快菊黄东方鲀是水产养殖者追求的目标。目前在菊黄东方鲀中,与生长相关的分子标记研究是空白。
肌肉生长抑制因子(Myostatin,MSTN)最先从小鼠骨骼肌cDNA文库克隆到,它主要在肌肉组织中大量表达,属于TGF-β超级家族。对MSTN基因敲除小鼠地研究表明,突变小鼠的体重比杂合体和野生型小鼠体重增加约30%,其中肌细胞增生(hyperplasia)和肌纤维肥大(hypertrophy)双重作用所造成的肌肉肥大是造成体重增加的主要原因,并且这一特性与动物的性别及年龄无关,而且不影响动物的繁殖能力。因此,MSTN是肌肉生长的一个重要负调控主效基因。活化的MSTN与细胞膜表面受体(活化素受体蛋白II B(ACVR2B)和活化素受体蛋白IB(ACVRB))相结合,可以激活下游的S妈的2/3和p38MAPK细胞内信号传导途径,从而调节各组织的生长发育。
在《黄颡鱼MSTN基因多肽性及其与生长性状的相关分析》(朱媛媛等,遗传,2012年1月34(1):72-78页)一文中,披露了MSTN对黄颡鱼生长速度的影响,通过转基因技术和DNAi技术抑制斑马鱼的MSTN基因发现实验鱼的肌肉明显比正常鱼发达,因此认为该基因在动物肌肉生长发育中起到重要抑制作用,也可能参与脂肪的生成和调节。在鱼类中,MSTN mDNA可以在肌肉,眼,脑、肠、腮、肾、心、脾中发现,并且在不同的鱼种中MSTN还分为两类,MSTN1、MSTN2(牙鲆肌肉生长抑制素(MSTN)基因克隆,徐建勇、陈松林,水产学报第32卷第4期,2008年7月,497-498)。
[发明内容]
为了弥补现有技术的空白,提供一种能够对于菊黄东方鲀生长速度进行检测的引物对。
菊黄东方鲀中存在可用于筛选生长相关的片段,该片段位于菊黄东方鲀MSTN2基因3端非翻译区域如序列SEQ ID NO:3及附图1所示。其中框里阴影部分为GT重复的微卫星核心区域。在菊黄东方鲀中存在染色体加倍现象,在扩增过程中,其他拷贝上的片段也会出现扩增现象。
在上述发现的基础上,发明一种检测菊黄东方鲀生长速度的引物对,该引物对由碱基序列为SEQ ID NO:1的上游引物和SEQ ID NO:2的下游引物组成。
本发明还包括一种检测菊黄东方鲀生长速度的方法,于由以下步骤组成,
提取样品菊黄东方鲀的肌肉生长抑制因子的DNA序列,
采用上述引物对作为PCR扩增的引物对样品进行PCR扩增;
将扩增产物进行PAGE、染色处理;
观察对比各个样品的条带,条带越多的个体生长速度越快。
上述方法还具有如下优化方案:
所述的PCR扩增的反应体系20μL,包括2ul 10×PCR缓冲液,0.8ul 10mmol/L的dNTP mix,0.4μmol/L的上游引物,0.4μmol/L的下游引物,30ng的样品菊黄东方鲀DNA。
所述的PCR扩增反应条件如下,94℃变性3分钟,然后94℃变性30秒,55℃复性30秒,及72℃延伸30秒,42个循环,最后72℃延伸10分钟。
通过本发明的引物对和检测方法,能够有效的对于不同个体的菊黄东方鲀的生长速度进行筛选,为人工育种提供有效的信息,筛选后能够得到生长速度块的个体养殖时间短,节约了养殖成本。并且其方法简单、速度快,能够广泛的用于各个地域。
[附图说明]
图1为菊黄东方鲀MSTN2基因中的微卫星核心区域示意图;
图2位不同样品菊黄东方鲀的PAGE条带对比图。
[具体实施方式]
下面通过具体实施例结合附图对本发明做进一步说明,下述实施例仅仅是为清楚地说明本发明所作的举例,而并非是对本发明的实施方式的限定。
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