[发明专利]基于微悬臂梁平台的蛋白质模式识别方法有效
申请号: | 201310639690.0 | 申请日: | 2013-12-04 |
公开(公告)号: | CN103675295A | 公开(公告)日: | 2014-03-26 |
发明(设计)人: | 王萍;樊春海;金彩虹;何丹农 | 申请(专利权)人: | 上海纳米技术及应用国家工程研究中心有限公司 |
主分类号: | G01N33/68 | 分类号: | G01N33/68 |
代理公司: | 上海东方易知识产权事务所 31121 | 代理人: | 唐莉莎 |
地址: | 200241 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 悬臂梁 平台 蛋白质 模式识别 方法 | ||
1.一种基于微悬臂梁的蛋白质模式识别方法,其特征在于:
基于微悬臂梁技术,将含有不同化学基团的化合物修饰于悬臂梁表面作为传感阵列,待测蛋白与该阵列接触反应,不同蛋白与该传感阵列间的分子相互作用力不同,从而造成微悬臂梁偏移中心的距离不同,通过测量这种距离,获得一组指纹数据,可区分不同蛋白;还利用了线性判别分析法分析多组指纹数据,证明了该方法可区分不同的蛋白质,具体步骤如下:
(1)传感阵列的制备
选用单面镀金的微悬臂梁探针,利用金与巯基之间的化学键,将6种带有不同化学基团的巯基化合物固定于微悬臂梁探针的镀金表面;这6种物质分别为:(3-巯基丙基)三甲氧基硅烷,11-巯基-1-十一醇,苄硫醇,1-十二硫醇,11-巯基十一烷酸,2-二甲氨基乙硫醇盐酸盐;当然也可以采用更多带有其他基团的化合物;
先将微悬臂梁探针置于无水乙醇中3分钟,后用紫外线照射5分钟灭菌;将此探针固定于修饰样品台上,每个梁分别浸入毛细管的一端,毛细管的另一端浸入待修饰溶液,利用毛细管的虹吸效应,使得不同的悬臂梁修饰上不同的巯基化合物;巯基化合物溶解于乙醇溶液中,浓度为100nM,修饰在室温进行,时间为30分钟;
(2)蛋白检测
将修饰好的传感阵列,微悬臂梁探针,置于检测池中,控制检测温度为25℃;先向检测池中冲入TE缓冲溶液(Tris-HCl 10mM, EDTA 1mM, NaCl 1M, pH7.4),静待微悬臂梁信号平稳,即空白曲线平稳后,加入0.1mg/ml的待测蛋白溶液,溶剂同为TE缓冲液;这时,所有的微梁都会由于结合了蛋白而向上或向下弯曲,根据蛋白与传感阵列上修饰化合物之间结合力的不同,微梁最终会达到不同的平衡值;
我们分别检测了6种不同的蛋白,数均分子量从11.7KDa到340KDa,等电点从4.47-7.8;微梁在5分钟以内达到稳定信号值;
本发明所采用的蛋白分别为:白蛋白Mw=68KDa, pI=4.7-4.9,细胞色素CMw=38KDa, pI=4.47-4.57,纤维蛋白原Mw=340KDa, pI=4.8,免疫球蛋白 GMw=150KDa, pI=7.4,脂蛋白Mw=38KDa, pI=4.9,枯草杆菌蛋白酶 BMw=27.6KDa, pI=7.8。
2.根据权利要求1所述基于微悬臂梁技术的蛋白质模式识别方法,其特征在于,所述微悬臂梁的探针为镀金,或其他类型探针。
3.根据权利要求1所述基于微悬臂梁技术的蛋白质模式识别方法,其特征在于,所述修饰于微梁上的化合物还可为DNA,或无机分子,或有机分子;其用于固定不同化合物的方法还可为抗原抗体反应,或DNA配对。
4.根据权利要求1所述基于微悬臂梁技术的蛋白质模式识别方法,其特征在于,所述待测蛋白还可为蛋白质,或其他聚合物,或DNA,或生物大分子。
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