[发明专利]一种土壤样品中微生物总DNA的提取方法在审
| 申请号: | 201310587102.3 | 申请日: | 2013-11-20 |
| 公开(公告)号: | CN104651350A | 公开(公告)日: | 2015-05-27 |
| 发明(设计)人: | 许科伟;赵克斌;任春;黄欣;汤玉平;杨帆;蒋涛 | 申请(专利权)人: | 中国石油化工股份有限公司;中国石油化工股份有限公司石油勘探开发研究院 |
| 主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京聿宏知识产权代理有限公司 11372 | 代理人: | 吴大建;刘华联 |
| 地址: | 100728 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 土壤 样品 微生物 dna 提取 方法 | ||
1.一种土壤样品中微生物总DNA的提取方法,包括:
步骤A,在土壤样品中加入DNA提取缓冲液后,对土壤样品中的微生物进行物理法细胞破碎;
步骤B,然后使用蛋白酶K溶液对步骤A得到的土壤样品中的微生物进行酶法细胞破碎;
步骤C,再对步骤B得到的土壤样品中的微生物进行化学法细胞破碎后,将所得溶液离心并收集上清液;
步骤D,用有机溶剂对所述上清液进行抽提后离心并收集上清液;在所述上清液中加入沉淀剂进行沉淀,离心并收集沉淀;然后将所述沉淀洗涤并干燥和溶解后,得到DNA粗提液;
步骤E,将所述DNA粗提液采用吸附柱纯化后得到纯化的DNA提取液。
2.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,步骤A中所述物理法细胞破碎为对其冻融2~5次;步骤B中酶法细胞破碎的水浴温度为30~45℃;步骤C中所述化学法细胞破碎为使用表面活性剂进行细胞破碎;优选所述表面活性剂为十二烷基磺酸钠溶液,且化学破碎的温度为60~70℃。
3.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,步骤D中对所述上清液用有机溶剂抽提包括先对所述上清液用苯酚、氯仿和异戊醇的混合液抽提,离心并收集上清液;再用氯仿和异戊醇的混合液抽提,离心并收集上清液;且所述沉淀剂为异丙醇。
4.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,步骤D中使用乙醇水溶液洗涤所述沉淀,且使用TE缓冲液溶解所述沉淀。
5.根据权利要求1~4中任意一项所述的提取方法,其特征在于,步骤A中所述DNA提取缓冲液中包含50~150mM的Tris-HCl、50~150mM的EDTA、50~150mM磷酸盐缓冲液和0.5~2.5M的NaCl;优选其中还包括0.5~2wt%的CTAB。
6.根据权利要求2所述的提取方法,其特征在于,步骤A所述冻融中的冷冻是在液氮环境下进行,而溶解是在60~70℃的水浴环境下进行。
7.根据权利要求1~6中任意一所述的提取方法,其特征在于,所述DNA提取缓冲液与所述土壤样品的质量比为1∶1~2∶1。
8.根据权利要求1~6中任意一所述的提取方法,其特征在于,所述吸附柱采用硅胶膜作为填料。
9.根据权利要求1~8中任意一项所述的提取方法,其特征在于,所述土壤样品为油气田土壤样品。
10.一种如权利要求1~9中任意一项所述的提取方法在油气勘探开发领域的应用。
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