[发明专利]一种用于猪病诊断的三重连接探针扩增检测方法在审
申请号: | 201310564210.9 | 申请日: | 2013-11-11 |
公开(公告)号: | CN103555861A | 公开(公告)日: | 2014-02-05 |
发明(设计)人: | 高慎阳;周铁忠;查恩辉;董筱萍;迟阳 | 申请(专利权)人: | 辽宁医学院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京神州华茂知识产权有限公司 11358 | 代理人: | 吴照幸 |
地址: | 121001 辽宁*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 诊断 三重 连接 探针 扩增 检测 方法 | ||
1.一种用于检测猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪瘟病毒以及猪伪狂犬病毒的靶核酸的探针和引物,其特征在于,包括如下的序列组:
1)针对猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因的探针
左翼探针Probe105L:5’TGGTTCGCTTAGGGTTGGTTGGCGCTACTCTTGTACCAGATA 3’
右翼探针Probe105R:5’TACCAACTTCCTTCTGGACACTGTGCCAGCAAGATCCAATCTC TCTGCACGATCCAATACCAC 3’
2)针对猪瘟病毒E2基因的探针
左翼探针Probe125L:5’TGGTTCGCTTAGGGTTGGTTTGGCAGGTTCCTTTAAAGTCACA 3’
右翼探针Probe125R:5’GCACTTAATGTGGTCAGTAGGAGTGCCAGCAAGATCCAATCTGTGC CAGCAAGATCCAATCTCTCTGCACGATCCAATACCAC 3’
3)针对猪伪狂犬病毒TK基因的探针
左翼探针Probe150L:5’TGGTTCGCTTAGGGTTGGTTTGCCAGCAAGATCCAATCTCCTG CGCAACGTCTACGCCAT 3’
右翼探针Probe150R:5’GCTGGTCAACACGTCGCGCTACCTGAGGTGCCAGCAAGATCCAAT CTGTGCCAGCAAGATCCAATCTGTCTCTGCACGATCCAATACCAC 3’
4)通用引物
正向引物UP1:5′TGGTTCGCTTAGGGTTGGTT 3′
反向引物UP2:5′GTGGTATTGGATCGTGCAGAGA 3′。
2.根据权利要求1所述的一种用于检测猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪瘟病毒以及猪伪狂犬病毒的靶核酸的探针和引物,其特征在于:所述右翼探针的5’端经过磷酸化修饰。
3.根据权利要求1所述的一种用于检测猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪瘟病毒以及猪伪狂犬病毒的靶核酸的探针和引物,其特征在于:所述5’TGGTTCGCTTAGGGTTGGTT与通用的正向引物UP1序列相同;所述TCTCTGCACGATCCAATACCAC 3’与通用的反向引物UP2序列反向互补。
4.一种用于检测猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪瘟病毒以及猪伪狂犬病毒的三重同步核酸定性检测试剂,其特征在于:包括MLPA杂交液、MLPA连接液、PCR反应液、RNA/DNA共提液、RT反应液、阳性对照品、阴性对照品、探针混合液、通用引物混合液、氯仿、异丙醇、75%乙醇、DEPC处理水;
MLPA杂交液包括SALSA MLPA buffer;
MLPA连接液包括Ligase-65buffer A,Ligase-65buffer B,Ligase-65连接酶;
PCR反应液包括2×Taq Master Mix;
RNA/DNA共提液包括苯酚、8-羟基喹啉、异硫氰酸胍、β-巯基乙醇;
RT反应液包括M-MLV5×Reaction Buffer、200U M-MLV反转录酶、2000U RNase抑制剂、10mM dNTP Mix;
阳性对照品为含1.0×108copy/ml浓度的高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因、猪瘟病毒基因E2基因以及猪伪狂犬病毒TK基因的DNA片段;
阴性对照品为不含高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因、猪瘟病毒E2基因以及猪伪狂犬病毒TK基因的pSURE-T重组质粒;
探针混合液为权利要求1所述的左翼探针、右翼探针;
通用引物混合液为权利要求1所述的UP1与UP2的混合液。
5.根据权利要求4所述的一种用于检测猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪瘟病毒以及猪伪狂犬病毒的三重同步核酸定性检测试剂,其特征在于:所述PCR反应液是由Taq DNA Polymerase、PCR Buffer、Mg2+、dNTPs以及PCR稳定剂和增强剂组成的预混体系,浓度为2×,预配好的PCR混合液中加入了溴芬蓝染料,反应结束后可直接进行电泳检测;75%乙醇需使用DEPC处理水配制。
6.一种用于检测猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪瘟病毒以及猪伪狂犬病毒的三重连接探针扩增检测方法,其特征在于有以下步骤:
1)将疑似已经感染猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪瘟病毒以及猪伪狂犬病毒的发病猪或死亡猪尸体内的血液、分泌液体以及淋巴结样品进行核酸提取处理,得到待测样品;
2)将待测样品进行同步反转录处理,得到待杂交检测模板;
3)将待杂交检测模板与探针进行杂交处理,得到杂交产物;
4)将杂交产物进行连接处理,得到连接产物;
5)将连接产物进行PCR反应处理,得到扩增产物;
6)将扩增产物进行琼脂糖凝胶核酸电泳处理,随后进行凝胶成像分析得到检测结果。
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