[发明专利]用于检测革兰阴性杆菌常见碳青霉烯酶基因的LAMP引物、试剂盒及其检测方法有效

专利信息
申请号: 201310545991.7 申请日: 2013-11-06
公开(公告)号: CN103614465A 公开(公告)日: 2014-03-05
发明(设计)人: 芮勇宇;程灿灿;郑芬;孙静静 申请(专利权)人: 南方医科大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 代理人: 郑莹
地址: 510515 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 用于 检测 阴性 杆菌 常见 青霉 基因 lamp 引物 试剂盒 及其 方法
【权利要求书】:

1. 用于检测革兰阴性杆菌常见碳青霉烯酶基因的LAMP引物,包括KPC引物组、NDM引物组、IMP引物组和VIM引物组,其核苷酸序列分别如下所示:

1) KPC引物组: 

外引物:

KF3:GTATCGCCGTCTAGTTCTG(SEQ ID NO.1),

KB3:TGAATGAGCTGCACAGTG(SEQ ID NO.2);

内引物:

KFIP:AATGGTTCCGCGACGAGGCTGTCTTGTCTCTCATGGC(SEQ ID NO.3),

KBIP:GGACTTTGGCGGCTCCATGCGCGGTAACTTACAGTT(SEQ ID NO.4);

环引物:

KLoopF:GGCAGAAAAGCCAGCCAG(SEQ ID NO.5),

KLoopB:CGATGGATACCGGCTCAG(SEQ ID NO.6);

2) NDM引物组: 

外引物:

NF3:AACACAGCCTGACTTTCG(SEQ ID NO.7),

NB3:GCTCATCACGATCATGCT(SEQ ID NO.8);

内引物:

NFIP:ATGTCGGTGCCGTCGATCCCCGCTCAAGGTATTTTACC(SEQ ID NO.9),

NBIP:GCTTTTGGTGGCTGCCTGATCACCGAGATTGCCGAG(SEQ ID NO.10);

环引物:

NLoopF:GATATTGTCACTGGTGTGGC(SEQ ID NO.11),

NLoopB:GGACAGCAAGGCCAAGTC(SEQ ID NO.12);

3) IMP引物组: 

外引物:

IF3:GGGCGTTGTTCCTAAACA(SEQ ID NO.13),

IB3:GCTTGAACCTTACCGTCTT(SEQ ID NO.14);

内引物:

IFIP:ACGTTCCACAAACCAAGTGACTGGTTGTTCTTGTAGATGCTGA(SEQ ID NO.15),

IBIP:CAGCACGGGCGGAATAGAGGCTCATTAGTTAATTCAGACGC(SEQ ID NO.16);

环引物:

ILoopF:TTAGCCGTAAATGGAGTGTCAA(SEQ ID NO.17),

ILoopB:TGGCTTAATTCTCAATCCATCC(SEQ ID NO.18);

4) VIM引物组: 

外引物:

VF3:CTTCGGTCCAGTAGAACTCT(SEQ ID NO.19),

VB3:GTGTGCTTGAGCAAGTCT(SEQ ID NO.20);

内引物:

VFIP:TCGCACAACCACCATAGAGCGCATTCGACCGACAACTT(SEQ ID NO.21),

VBIP:GTTGTCACGCACGTCTGCGAATCCGCTCAATGGAGG(SEQ ID NO.22);

环引物:

VLoopF:GACGGGACGTACACAACT(SEQ ID NO.23),

VLoopB:GATGCCGATCTGGCTGAA(SEQ ID NO.24)。

2. 用于检测革兰阴性杆菌常见碳青霉烯酶基因的LAMP试剂盒,其特征在于:该试剂盒包括权利要求1所述的LAMP引物。

3. 根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:该试剂盒包括以下组份:(1)权利要求1所述的LAMP引物;(2)2×反应缓冲液;(3)DNA Bst聚合酶;(4)荧光指示剂或显色剂;(5)阳性对照;(6)阴性对照。

4. 根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于:2×反应缓冲液包括:40mM Tris-HCl(pH 8.8),20mM KCl,16mM MgSO4,20mM (NH4)2SO4,0.2v/v% Tween-20,0.8M甜菜碱,2.8mM dNTPs。

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