[发明专利]用于检测革兰阴性杆菌常见碳青霉烯酶基因的LAMP引物、试剂盒及其检测方法有效
申请号: | 201310545991.7 | 申请日: | 2013-11-06 |
公开(公告)号: | CN103614465A | 公开(公告)日: | 2014-03-05 |
发明(设计)人: | 芮勇宇;程灿灿;郑芬;孙静静 | 申请(专利权)人: | 南方医科大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 郑莹 |
地址: | 510515 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 阴性 杆菌 常见 青霉 基因 lamp 引物 试剂盒 及其 方法 | ||
1. 用于检测革兰阴性杆菌常见碳青霉烯酶基因的LAMP引物,包括KPC引物组、NDM引物组、IMP引物组和VIM引物组,其核苷酸序列分别如下所示:
1) KPC引物组:
外引物:
KF3:GTATCGCCGTCTAGTTCTG(SEQ ID NO.1),
KB3:TGAATGAGCTGCACAGTG(SEQ ID NO.2);
内引物:
KFIP:AATGGTTCCGCGACGAGGCTGTCTTGTCTCTCATGGC(SEQ ID NO.3),
KBIP:GGACTTTGGCGGCTCCATGCGCGGTAACTTACAGTT(SEQ ID NO.4);
环引物:
KLoopF:GGCAGAAAAGCCAGCCAG(SEQ ID NO.5),
KLoopB:CGATGGATACCGGCTCAG(SEQ ID NO.6);
2) NDM引物组:
外引物:
NF3:AACACAGCCTGACTTTCG(SEQ ID NO.7),
NB3:GCTCATCACGATCATGCT(SEQ ID NO.8);
内引物:
NFIP:ATGTCGGTGCCGTCGATCCCCGCTCAAGGTATTTTACC(SEQ ID NO.9),
NBIP:GCTTTTGGTGGCTGCCTGATCACCGAGATTGCCGAG(SEQ ID NO.10);
环引物:
NLoopF:GATATTGTCACTGGTGTGGC(SEQ ID NO.11),
NLoopB:GGACAGCAAGGCCAAGTC(SEQ ID NO.12);
3) IMP引物组:
外引物:
IF3:GGGCGTTGTTCCTAAACA(SEQ ID NO.13),
IB3:GCTTGAACCTTACCGTCTT(SEQ ID NO.14);
内引物:
IFIP:ACGTTCCACAAACCAAGTGACTGGTTGTTCTTGTAGATGCTGA(SEQ ID NO.15),
IBIP:CAGCACGGGCGGAATAGAGGCTCATTAGTTAATTCAGACGC(SEQ ID NO.16);
环引物:
ILoopF:TTAGCCGTAAATGGAGTGTCAA(SEQ ID NO.17),
ILoopB:TGGCTTAATTCTCAATCCATCC(SEQ ID NO.18);
4) VIM引物组:
外引物:
VF3:CTTCGGTCCAGTAGAACTCT(SEQ ID NO.19),
VB3:GTGTGCTTGAGCAAGTCT(SEQ ID NO.20);
内引物:
VFIP:TCGCACAACCACCATAGAGCGCATTCGACCGACAACTT(SEQ ID NO.21),
VBIP:GTTGTCACGCACGTCTGCGAATCCGCTCAATGGAGG(SEQ ID NO.22);
环引物:
VLoopF:GACGGGACGTACACAACT(SEQ ID NO.23),
VLoopB:GATGCCGATCTGGCTGAA(SEQ ID NO.24)。
2. 用于检测革兰阴性杆菌常见碳青霉烯酶基因的LAMP试剂盒,其特征在于:该试剂盒包括权利要求1所述的LAMP引物。
3. 根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:该试剂盒包括以下组份:(1)权利要求1所述的LAMP引物;(2)2×反应缓冲液;(3)DNA Bst聚合酶;(4)荧光指示剂或显色剂;(5)阳性对照;(6)阴性对照。
4. 根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于:2×反应缓冲液包括:40mM Tris-HCl(pH 8.8),20mM KCl,16mM MgSO4,20mM (NH4)2SO4,0.2v/v% Tween-20,0.8M甜菜碱,2.8mM dNTPs。
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