[发明专利]一种用于β-地中海贫血β17(A→T)点突变的检测试剂盒及ARMS-QPCR检测方法有效
| 申请号: | 201310528510.1 | 申请日: | 2013-10-30 |
| 公开(公告)号: | CN103589793A | 公开(公告)日: | 2014-02-19 |
| 发明(设计)人: | 龚剑;王新旺;吴晶萍;熊许洁 | 申请(专利权)人: | 苏州发士达生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 | 代理人: | 董建林 |
| 地址: | 215211 江苏省*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 用于 地中海贫血 17 突变 检测 试剂盒 arms qpcr 方法 | ||
1.一种用于β-地中海贫血β17 (A→T)点突变的检测试剂盒,其特征在于:
PCR反应液Ⅰ包括上游引物Ⅰ、探针和下游引物,用于扩增出野生型阳性DNA模板;
PCR反应液Ⅱ包括上游引物Ⅱ、探针和下游引物,用于扩增出突变型阳性DNA模板;
所述上游引物Ⅰ3’位末端碱基为A,所述上游引物Ⅱ3’位末端碱基为T。
2.根据权利要求1所述的一种用于β-地中海贫血β17 (A→T)点突变的检测试剂盒,其特征在于:所述上游引物Ⅰ、上游引物Ⅱ、探针和下游引物的序列分别为:
上游引物Ⅰ:5’-TCTGCCGTTACTGCCCTGTGGGGCA-3’;
上游引物Ⅱ:5’-TCTGCCGTTACTGCCCTGTGGGGCT-3’;
探针:5’-(FAM) GGCCCTGGGCAGGTTGGTATCAAGGT(DABCYL)-3’;
下游引物:5’-ACCCAAGAGTCTTCTCTGTCTCCACAT-3’。
3.根据权利要求1所述的一种用于β-地中海贫血β17 (A→T)点突变的检测试剂盒,其特征在于:试剂盒还包括混合酶液、DNA提取液、阴性对照液和阳性对照品,所述混合酶液包括DNA聚合酶、灭菌超纯水Ⅰ和显色液,所述PCR反应液Ⅰ和PCR反应液Ⅱ均还包括灭菌超纯水Ⅱ、缓冲液、氯化镁和dNTPs。
4.根据权利要求1或3所述的一种用于β-地中海贫血β17 (A→T)点突变的检测试剂盒,其特征在于:所述灭菌超纯水Ⅱ、缓冲液、氯化镁、dNTPs、上游引物Ⅰ、上游引物Ⅱ、下游引物、探针、DNA聚合酶、灭菌超纯水Ⅰ和显色液含量如下:
灭菌超纯水Ⅱ 体积为11.4~4.8 μl /管;
缓冲液 浓度为5~15×Buffer 体积为2~4 μl /管;
氯化镁 浓度为20~30 mM 体积为2~4 μl /管;
dNTPs 浓度为2.0~3.0mM 体积为2~4 μl /管;
上游引物Ⅰ 浓度为30~100 μM 体积为 0.1~0.2 μl /管;
上游引物Ⅱ 浓度为30~100 μM 体积为 0.1~0.2 μl /管;
下游引物 浓度为30~100 μM 体积为0.1~0.2 μl /管;
探针 浓度为30~100 μM 体积为0.06~0.2 μl /管;
DNA聚合酶 浓度为3~10U/ul 体积为0.15~0.3μl /管;
显色液 体积为 0.01~0.02μl /管;
灭菌超纯水Ⅰ 体积为1.84~1.68 μl /管。
5.根据权利要求1所述的一种用于β-地中海贫血β17 (A→T)点突变的检测试剂盒,其特征在于:所述DNA聚合酶为Taq酶,所述显色液为溴酚蓝。
6.根据权利要求1所述的一种用于β-地中海贫血β17 (A→T)点突变的检测试剂盒,其特征在于:所述DNA提取液的提取方法为苯酚-氯仿抽提法。
7.一种用于β-地中海贫血β17 (A→T)点突变的ARMS-QPCR检测方法,其特征在于:包括如下步骤:
样品采集:以β-地中海贫血的合成DNA模板为检测样本;
样品处理:将待检β-地中海贫血β17 (A→T)点突变的DNA模板使用苯酚/氯仿抽提方法提取基因组DNA,获得DNA样品;
样品检测:将获得的DNA样品进行荧光定量PCR检测,荧光定量PCR检测步骤中使用一种用于β-地中海贫血β17 (A→T)点突变的检测试剂盒。
8.根据权利要求7所述的一种用于β-地中海贫血β17 (A→T)点突变的ARMS-QPCR检测方法,其特征在于:所述PCR反应的反应条件为:50~55℃反应2~5min,94~95℃反应2~3min,94~95℃反应5~10s,55~60℃反应40~80s,35~39个循环。
9.根据权利要求7或8所述一种用于β-地中海贫血β17 (A→T)点突变的ARMS-QPCR检测方法在一种用于β-地中海贫血β17 (A→T)点突变的检测试剂盒中的应用。
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