[发明专利]还原敏感偶氮连接单元的合成及其在DNA测序中的用途有效
申请号: | 201310462509.3 | 申请日: | 2013-09-30 |
公开(公告)号: | CN103539697A | 公开(公告)日: | 2014-01-29 |
发明(设计)人: | 沈玉梅;刘亚智;赵小东;邵志峰;汤道年;江敏;龚兵;伍新燕;李小卫 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学;华东理工大学 |
主分类号: | C07C245/08 | 分类号: | C07C245/08;C07H19/10;C07H1/00;C12Q1/68 |
代理公司: | 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 | 代理人: | 牛山;陈少凌 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 还原 敏感 偶氮 连接 单元 合成 及其 dna 中的 用途 | ||
1.一种还原敏感偶氮连接单元,其结构式如式(I)所示:
其中m为0~44中任一整数,n为0~44中任一整数。
2.如权利要求1所述的还原敏感偶氮连接单元,其特征在于,所述m为0~10中任一整数,n为0~10中任一整数。
3.如权利要求2所述的还原敏感偶氮连接单元,其特征在于,所述m=1,n为0~10中任一整数。
4.一种如权利要求1所述的还原敏感偶氮连接单元的合成方法,其特征在于,包括如下步骤:
第一步、在DMF存在的条件下,碳酸钾、化合物E和化合物G反应,得到化合物H所述碳酸钾、化合物E和化合物G的摩尔比为(1.0~1.5):(3.0~5.5):1.0;
第二步、在冰浴的条件下,TFA和化合物H反应,得到化合物I所述TFA和化合物H的摩尔比为(3.0~8.0):1.0。
5.如权利要求4所述的还原敏感偶氮连接单元的合成方法,其特征在于,所述化合物E的合成包括如下步骤:
A、在甲苯存在的条件下,摩尔比为(1.0~3.5):1.0的48%HBr与化合物A反应,得到化合物B其中,n为0~44中任一整数;
B、在氨水存在条件下,化合物B和氨水反应,得到化合物C所述氨水与化合物B的摩尔比为(1.0~30):1.0;
C、在水、甲醇和氢氧化钠存在的条件下,BOC酸酐和化合物C反应,得到化合物D所述BOC酸酐和化合物C的摩尔比为(1.0~3.5):1.0;
D、在三乙胺、DMAP存在的条件下,化合物TsCl和化合物D反应,得到化合物E所述三乙胺、DMAP、TsCl和化合物D的摩尔比为(1.0~5.0):(0.1~0.5):(1.0~4.0):1.0。
6.如权利要求4所述的还原敏感偶氮连接单元的合成方法,其特征在于,所述化合物G的合成包括如下步骤:
在水、甲醇存在的条件下,亚硝酸钠、4-氨基苯乙醇和化合物F反应,得到化合物G所述亚硝酸钠、4-氨基苯乙醇和化合物F的摩尔比为(1.0~4.5):1.0;(1.0~1.5);其中,m为0~44中任一整数。
7.一种如权利要求1所述的还原敏感偶氮连接单元在DNA测序中的用途,其特征在于,所述还原敏感偶氮连接单元与核苷酸及荧光素连接得到可逆终端,所述可逆终端用于DNA合成测序。
8.一种可逆终端,其特征在于,所述可逆终端由如权利要求1所述的还原敏感偶氮连接单元与核苷酸及荧光素连接而得。
9.如权利要求8所述的可逆终端,其特征在于,所述连接具体包括如下步骤:
A、以无水DMF为溶剂,在TEA存在的条件下,所述还原敏感偶氮连接单元与TAMRA(5/6)反应,得化合物J所述TAMRA(5/6)、还原敏感偶氮连接单元和TEA的摩尔比为1:(1~3):(3~10);
B、在DMAP、DIPEA存在的条件下,化合物J和DSC反应,得到中间体K该中间体K与dUTP(AP3)反应,得到化合物L所述化合物J、DSC、DMAP、DIPEA和dUTP(AP3)的摩尔比为1:(5~12):(2~3):(2~4):(2~8)。
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