[发明专利]一种鸡基因的单核苷酸多态性、检测方法及其应用有效
申请号: | 201310450040.1 | 申请日: | 2013-09-27 |
公开(公告)号: | CN103710427A | 公开(公告)日: | 2014-04-09 |
发明(设计)人: | 孙桂荣;王顺红;康相涛;李红;刘小军;蒋瑞瑞;田亚东;李国喜;韩瑞丽;闫峰宾;王彦彬;李转见 | 申请(专利权)人: | 河南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 郑州睿信知识产权代理有限公司 41119 | 代理人: | 牛爱周 |
地址: | 450002*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基因 核苷酸 多态性 检测 方法 及其 应用 | ||
1.一种鸡miRNA-1704基因的单核苷酸多态性,其特征在于,所述单核苷酸多态性为在如SEQ ID NO.3所示的鸡miRNA-1704基因序列中,其序列第148位为C或G。
2.一种鸡miRNA-1704基因的单核苷酸多态性的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)以包含miRNA-1704基因的鸡全基因组DNA为模板,设计一对引物;
(2)以引物对P为引物,PCR扩增鸡miRNA-1704基因;
(3)用限制性内切酶EcoRⅠ消化PCR扩增产物,再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定鸡miRNA-1704基因序列中第148位的单核苷酸多态性:当鸡miRNA-1704基因的第148位点为G时,酶切后电泳图谱为两条带,条带大小为184bp和148bp,命名为GG基因型;当鸡miRNA-1704基因的第148位点为C时,酶切后电泳图谱为一条带,条带大小为332bp,命名为CC基因型;当鸡miRNA-1704基因的第148位点为杂合的个体时,酶切后电泳图谱为三条带,条带大小为332bp,184bp和148bp,命名为GC基因型。
3.根据权利要求2所述的一种鸡miRNA-1704基因的单核苷酸多态性的检测方法,其特征在于,所述的引物对P为:
正向引物:5’-AGCTCTGTTGGGTTGAAGGAGTAG-3’;
反向引物:5’-GTGCATCTCCCACAGCTGCCATAG-3’。
4.根据权利要求2所述的一种鸡miRNA-1704基因的单核苷酸多态性的检测方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应体系为:2×Taq PCR Master Mix12μL、10pmol/L的正、反向引物各1μL、100ng/μL DNA模板0.5μL、灭菌超纯水10.5μL,总体积25μL。
5.根据权利要求2所述的一种鸡miRNA-1704基因的单核苷酸多态性的检测方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应程序为:94℃预变性5min;94℃变性30s,60.2℃退火30s,72℃延伸30s,35个循环;72℃延伸10min。
6.根据权利要求2所述的一种鸡miRNA-1704基因的单核苷酸多态性的检测方法,其特征在于,所述琼脂糖凝胶电泳所用的琼脂的质量分数为1.5%。
7.一种鸡miRNA-1704基因的单核苷酸多态性的检测方法的应用,其特征在于,所述的检测方法可用于鸡的辅助选择和分子育种。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,通过将基因型与鸡的生长性状进行关联性分析,确定基因与性状的对应关系,用于鸡的分子育种。
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