[发明专利]用于将数据与生物序列关联的方法和装置有效
申请号: | 201310445223.4 | 申请日: | 2013-09-26 |
公开(公告)号: | CN103699558B | 公开(公告)日: | 2017-04-05 |
发明(设计)人: | J·R·克泽罗斯基;C·A·皮茨克维尔;J·M·维本;周如洪 | 申请(专利权)人: | 国际商业机器公司 |
主分类号: | G06F17/30 | 分类号: | G06F17/30 |
代理公司: | 北京市中咨律师事务所11247 | 代理人: | 于静,张亚非 |
地址: | 美国*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 数据 生物 序列 关联 方法 装置 | ||
1.一种用于将数据与目标生物序列关联的方法,包括:
在网络中标识对数据的一个或多个引用,所述数据具有大于预定阈值的相关性级别;
由处理器将所述一个或多个引用与一个或多个探测序列关联,所述一个或多个探测序列对应于与所述数据有关的生物序列的片段;
由所述处理器根据一个或多个准则对所述一个或多个探测序列进行排序;以及
由所述处理器至少根据每个引用的排序,为所述一个或多个探测序列分配与所述目标生物序列的片段的亲和性级别。
2.根据权利要求1的方法,其中所述引用是统一资源定位符URL。
3.根据权利要求1的方法,其中标识具有大于预定阈值的相关性级别的所述一个或多个引用包括:分析所述一个或多个引用,以便检测所述一个或多个引用的关键字、词组、符号和源中的一个或多个的存在。
4.根据权利要求1的方法,其中将每个引用与对应于生物序列的片段的探测序列关联包括:将每个引用关联于与所述数据有关的所述生物序列的所述片段互补的生物序列。
5.根据权利要求1的方法,其中对所述一个或多个探测序列进行排序包括:确定每个探测序列和与所述引用有关的所述生物序列之间的相似性,以及
对所述一个或多个探测序列进行排序进一步包括以下操作中的至少一个:确定每个引用的源的重要性、确定每个引用的普及性,以及确定每个引用对与所述引用有关的所述生物序列的历史适用性。
6.根据权利要求5的方法,其中确定每个引用和与所述引用有关的所述生物序列之间的相似性包括:确定每个引用和所述生物序列的补充物之间的匹配。
7.根据权利要求6的方法,其中所述数据包括文档、分析工具和传记信息中的至少一个,所述方法还包括将所述一个或多个探测序列与所述文档、所述分析工具和所述传记信息中的至少一个相关联。
8.根据权利要求7的方法,其中确定每个引用的源的重要性包括以下操作中的至少一个:确定所述文档的作者的引述数量、确定所述文档的作者所属的组织,以及确定由所述分析工具执行的分析类型,
确定每个引用的普及性包括以下操作中的至少一个:确定所述文档的引述数量和所述分析工具的使用频率,以及
确定每个引用对与所述引用有关的所述生物序列的历史适用性包括以下操作中的至少一个:确定结合所述生物序列而引述所述文档的频率,以及确定使用所述分析工具来分析所述生物序列的频率。
9.根据权利要求6的方法,其中所述至少一个探测序列包括对应于所述目标生物序列的同一片段的两个或更多个探测序列,以及
为所述两个或更多个探测序列分配与所述目标生物序列的所述同一片段的亲和性级别包括竞争性地比较所述两个或更多个探测序列,以便为具有较高排序的探测序列分配高于具有较低排序的探测序列的亲和性级别。
10.根据权利要求1的方法,还包括在显示器上显示所述目标生物序列的所述片段的图形表示;以及
通过基于每个探测序列与所述目标生物序列的所述片段的亲和性级别调整该探测序列的图形表示与所述片段的所述图形表示的物理距离而在所述显示器上显示所述亲和性级别的图形表示。
11.根据权利要求1的方法,还包括:
根据与所述生物序列的所述片段的所述亲和性级别,将所述两个或更多个引用中的第一引用与第一探测序列相关联;以及
根据所确定的表示所述网络中的数据的第二探测序列与所述第一探测序列的亲和性,模拟所述第二探测序列到所述第一探测序列的退火。
12.一种用于对生物序列模拟退火的方法,包括:
标识目标生物序列;
根据对数据的多个引用具有高于阈值相关性级别的相关性级别的判定,在网络中将所述多个引用标识为相关引用;
将所述相关引用与所述目标生物序列的至少一个片段关联;以及
根据预定准则对所述相关引用进行排序,以便确定所述相关引用与所述目标生物序列的所述至少一个片段的亲和性级别。
13.根据权利要求12的方法,其中标识所述目标生物序列包括:在连接到所述网络的主计算机中标识用户所选择的生物序列。
14.根据权利要求13的方法,其中通过在显示设备上显示所述生物序列的图形表示而选择所述生物序列。
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