[发明专利]一种淡水小龙虾MT基因表达模式用于水体质量评价的方法无效
申请号: | 201310403798.X | 申请日: | 2013-09-06 |
公开(公告)号: | CN103451297A | 公开(公告)日: | 2013-12-18 |
发明(设计)人: | 杜志强;张雪峰;王建英 | 申请(专利权)人: | 内蒙古科技大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 包头市专利事务所 15101 | 代理人: | 庄英菊 |
地址: | 014010 内蒙*** | 国省代码: | 内蒙古;15 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 淡水 小龙虾 mt 基因 表达 模式 用于 水体 质量 评价 方法 | ||
1.一种淡水小龙虾MT基因表达模式用于水体质量评价的方法,其特征在于,采用MT基因表达模式进行水体质量评价。
2.根据权利要求1所述的一种淡水小龙虾MT基因表达模式用于水体质量评价的方法,其特征在于,包含以下步骤:
1)污水水样的预处理:对污水水样进行稀释,稀释倍数为污水水样的5倍-10倍;
2)污水胁迫刺激:将步骤(1)中稀释后的污水分成三组,将小龙虾分别放入进行胁迫刺激,同时进行平行试验,小龙虾的放入数量要保证每个取样时间点都有活的小龙虾可取;
3)模板制制备:采用总RNA提取与cDNA的反转录合成联合的方法来制备cDNA;
4)实时荧光定量PCR技术确定MT基因的表达模式:以步骤(3)制备的cDNA作为模板进行实时荧光定量PCR,过程中使用的淡水小龙虾MT基因扩增引物为MT-qRT-F引物:5`-gagtgtgccgagggcgggt-3`,MT-qRT-R引物:5`-gcagggcttggagcaggtc-3`,扩增作为内参的淡水小龙虾18S rRNA基因的引物是18S-qRT-F引物:5`-tcttcttagagggattagcgg-3`,18S-qRT-R引物:5`-aaggggattgaacgggtta-3`,具体扩增程序的反应条件为:95℃预变性3min,之后为反复进行的40个循环,每个循环设置为:95℃变性30s,59℃退火30s,从55℃-95℃按照每秒升高0.5℃的进度进行退火,获得反应过程对应的溶解曲线,并且进行Ct值读数;
5)定性评价淡水小龙虾MT基因的表达模式与水样污染程度之间的关系:对步骤(4)溶解曲线读取的Ct值数据进行分析,数据分析的具体方法为:数据的计算形式为2-ΔCt,其中每一个时间点的ΔCt=(MT基因平均Ct值-18S rRNA基因平均Ct值),之后利用excell数据分析工具,以胁迫时间作为横坐标,以2-ΔCt值作为纵坐标来绘制柱形图,最后要以正常组淡水小龙虾的2-ΔCt值作为参照,采用T检验的数据分析方法分析其他各个取样时间点的2-ΔCt数值与正常组淡水小龙虾的2-ΔCt数值之间的显著性差异,当淡水小龙虾MT基因的最高相对表达量对应的2-ΔCt数值与正常组淡水小龙虾的2-ΔCt数值之间存在显著性差异的时候,确定为中度污染,当淡水小龙虾MT基因的最高相对表达量对应的2-ΔCt数值与正常组淡水小龙虾的2-ΔCt数值之间存在极显著差异的时候,确定为严重污染。
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