[发明专利]一种基于猪CD163基因的双荧光素酶报告基因载体有效
申请号: | 201310384901.0 | 申请日: | 2013-08-29 |
公开(公告)号: | CN103468730A | 公开(公告)日: | 2013-12-25 |
发明(设计)人: | 吴俊静;梅书棋;彭先文;乔木;武华玉;刘贵生;宋忠旭;孙华;李良华;李明波;董斌科 | 申请(专利权)人: | 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所 |
主分类号: | C12N15/63 | 分类号: | C12N15/63;C12N15/11;C12N15/66 |
代理公司: | 武汉宇晨专利事务所 42001 | 代理人: | 张红兵 |
地址: | 430064 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 cd163 基因 荧光 报告 载体 | ||
1.一种基于猪CD163基因的双荧光素酶报告基因载体psi-CHECK2-CD163-3UTR,其特征在于:该载体包含SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列,该序列位于猪CD163基因的3’UTR区。
2.一种扩增猪CD163基因cDNA3’末端的上游引物,其特征在于:所述引物的DNA序列如下所示:
外引物:CAGGTCGCTCATCTTTTGTTGC,
内引物:GCCTGAAAGCAGATGAAACGGA。
3.一种扩增猪CD163基因469bp片段的引物对,其特征在于:所述引物对的DNA序列如下所示:
上游引物:CCGCTCGAGTCGCTCATCTTTTGTTGC,
下游引物:ATTTGCGGCCGCTTTTATTTAATGCCCTTG。
4.一种用于非诊断目的的基于猪CD163基因的双荧光素酶报告基因载体psi-CHECK2-CD163-3UTR的制备方法,其特征在于:该载体通过以下步骤制备得到:
(1)参考猪CD163基因cDNA序列,利用cDNA3’末端快速扩增结合槽式降落PCR克隆获得猪CD163基因完整3’UTR片段,其核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示;
(2)利用生物信息学工具TargenScan,预测调控猪CD163基因表达的物种间保守microRNAs及靶位点序列,对比扩增的猪3’UTR区序列,寻找包含保守microRNAs的靶位点序列TGAATGT和AATGTGA;
(3)结合猪CD163基因CDS和SEQ ID NO:3所示核苷酸序列,设计包含microRNAs的靶位点序列的一对引物,该引物对的DNA序列如SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:5所示,利用PCR扩增猪CD163基因,得到如SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列,其长度为469bp;
(4)将步骤(3)扩增的序列插入双荧光素酶报告基因载体psi-CHECK2中,通过酶切、连接、转化感受态细胞、筛选阳性克隆并测序验证、抽提重组质粒DNA并做双酶切鉴定,获得猪CD163基因双荧光素酶报告基因载体psi-CHECK2-CD163-3UTR,其核苷酸序列如SEQ ID NO:7所示。
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