[发明专利]考虑重复性的碱基序列重组系统及方法

权利要求书

1.一种碱基序列重组系统，包括：

片段序列生成单元，用于由短片段生成多个片段序列；

片段序列长度调整单元，从生成的所述多个片段序列当中选择对象碱基序列上的映射重复数超过设定基准值的片段序列，并调整选择的片段序列的长度，直到所述选择的片段序列的映射重复数达到所述基准值以下；

比对单元，利用所述片段序列执行全局比对。

2.如权利要求1所述的碱基序列重组系统，其中，所述片段序列长度调整单元在所述选择的片段序列上附加构成所述短片段的一部分的一个以上的碱基。

3.如权利要求2所述的碱基序列重组系统，其中，所述片段序列长度调整单元在所述选择的片段序列的起始端或末端上增加对应于相应位置的所述短片段上的碱基。

4.如权利要求1所述的碱基序列重组系统，其中，所述片段序列长度调整单元在长度得到调整的片段序列没有被映射于所述对象碱基序列的情况下，除去所述长度得到调整的片段序列。

5.如权利要求1所述的碱基序列重组系统，还包括筛选单元，用于当生成的所述多个片段序列中存在对象碱基序列上的映射重复数超过设定上限值的片段序列时，除去对应片段序列。

6.如权利要求5所述的碱基序列重组系统，其中，所述上限值为10000。

7.一种碱基序列重组系统，包括：

片段序列生成单元，用于由短片段生成多个片段序列；

筛选单元，用于从生成的所述多个片段序列中除去对象碱基序列上的映射重复数超过设定上限值的片段序列；

比对单元，利用除了被除去的所述片段序列以外的其余片段序列而执行全局比对。

8.如权利要求7所述的碱基序列重组系统，其中，所述上限值为10000。

9.一种碱基序列重组方法，包括如下步骤：

在片段序列生成单元中，由短片段生成多个片段序列；

在片段序列长度调整单元中，从生成的所述多个片段序列当中选择对象碱基序列上的映射重复数超过设定基准值的片段序列，并调整选择的片段序列的长度，直到所述选择的片段序列的映射重复数达到所述基准值以下；

在比对单元中，利用所述片段序列执行全局比对。

10.如权利要求9所述的碱基序列重组方法，其中，在调整所述片段序列的长度的步骤中，在所述选择的片段序列上附加构成所述短片段的一部分的一个以上的碱基。

11.如权利要求10所述的碱基序列重组方法，其中，在调整所述片段序列的长度的步骤中，在所述选择的片段序列的起始端或末端上增加对应于相应位置的所述短片段上的碱基。

12.如权利要求9所述的碱基序列重组方法，其中，在调整所述片段序列的长度的步骤中，在长度得到调整的片段序列没有被映射于所述对象碱基序列的情况下，除去所述长度得到调整的片段序列。

13.如权利要求9所述的碱基序列重组方法，其中在执行生成所述片段序列的步骤之后还包括如下的筛选步骤：

如果在生成的所述多个片段序列中存在对象碱基序列上的映射重复数超过设定上限值的片段序列，则除去对应的片段序列。

14.如权利要求13所述的碱基序列重组方法，其中，所述上限值为10000。

15.一种碱基序列重组方法，包括如下步骤：

在片段序列生成单元中，由短片段生成多个片段序列；

在筛选单元中，从生成的所述多个片段序列中除去对象碱基序列上的映射重复数超过设定上限值的片段序列；

在比对单元中，利用除了被除去的所述片段序列以外的其余片段序列而执行全局比对。

16.如权利要求15所述的碱基序列重组方法，其中，所述上限值为10000。