[发明专利]一种快速鉴定病原真菌的方法有效
| 申请号: | 201310320242.4 | 申请日: | 2013-07-26 |
| 公开(公告)号: | CN103343168A | 公开(公告)日: | 2013-10-09 |
| 发明(设计)人: | 晏立英;廖伯寿;雷永;黄家权;万丽云;温少华 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院油料作物研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
| 代理公司: | 湖北武汉永嘉专利代理有限公司 42102 | 代理人: | 唐万荣 |
| 地址: | 430062 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 快速 鉴定 病原 真菌 方法 | ||
1.一种快速鉴定病原真菌的方法,其特征在于包括如下步骤:
(1)培养待鉴定真菌,得到真菌菌丝体、菌核、或分生孢子;
(2)取上述真菌菌丝体、菌核、或分生孢子置于缓冲液中,进行微波热振破壁处理后,置于冰上,离心后取上清液,即为真菌DNA提取液;
(3)利用真菌通用引物ITS1和ITS4对上述真菌DNA提取液进行PCR扩增,扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,再利用PCR回收试剂盒回收纯化得到目的片段;
(4)将上述目的片段直接进行序列分析,得到的核苷酸序列在NCBI网站利用blast搜索与之相匹配的真菌序列,匹配长度最长,序列一致性为100%的真菌判定为被鉴定真菌所属的真菌。
2.根据权利要求1所述方法,其特征在于步骤(1)所述待鉴定真菌选自:花生黄曲霉菌、花生白绢病菌、花生焦斑病菌、花生镰刀病菌、花生链格孢菌、苹果纹枯病菌、番茄叶霉病菌、小麦全蚀病菌、草坪币斑病菌、棉花黄萎病菌、瓜类蔓枯病菌、水稻稻曲病菌、黄瓜黑星病菌、玉米弯孢病菌、甘薯黑斑病菌、水稻稻瘟病菌、黄瓜枯萎病菌、哈密瓜枯萎病菌、白菜黑斑病菌、高粱立枯病菌、柑橘疮痂病菌、麻黄串珠镰刀真菌、辣椒炭疽病菌、黄瓜炭疽病菌、或禾谷镰刀真菌。
3.根据权利要求1所述方法,其特征在于步骤(1)所述真菌在PDA培养基或察氏培养基上进行平板或斜面培养。
4.根据权利要求1所述方法,其特征在于步骤(1)所述真菌在PDA培养基上28℃暗培养1~5天至菌落长至2~3cm,得到所述真菌菌丝体;或所述真菌在PDA培养基上28℃黑暗培养7~15天,得到所述菌核;或所述真菌在察氏培养基上28℃黑暗培养5~7天,得到所述分生孢子。
5.根据权利要求1所述方法,其特征在于步骤(2)所述真菌菌丝体、菌核、或分生孢子的质量为0.2~2mg。
6.根据权利要求1所述方法,其特征在于步骤(2)所述缓冲液为TE缓冲液,其组成成分为:10mM Tris-HCl,1mM EDTA,pH=8.0。
7.根据权利要求1所述方法,其特征在于步骤(2)所述微波热振破壁处理的微波功率为750W,微波处理的时间为30s~5min。
8.根据权利要求1所述方法,其特征在于步骤(2)所述微波热振破壁处理后,立即置于冰上5~10min,然后进行离心。
9.根据权利要求1所述方法,其特征在于所述离心在室温下进行,离心的转速为10000rpm,离心的时间为1~2min。
10.根据权利要求1所述方法,其特征在于所述PCR扩增的体系为:10×Taq缓冲液2μl、10pmol的ITS1引物和ITS4引物各1μl、真菌DNA提取液2μl、1UTaq DNA聚合酶1μl、2.5mM MgCl21μl、2mmol/L dNTPs1μl、及灭菌水补足至20μl;扩增条件为:94℃3min变性,94℃30s,51℃30s,72℃1min,35个循环,72℃7min延伸。
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