[发明专利]用于鉴定金花茶的SNP分子标记及其应用有效
申请号: | 201310300890.3 | 申请日: | 2013-07-17 |
公开(公告)号: | CN104293776A | 公开(公告)日: | 2015-01-21 |
发明(设计)人: | 宋云;赵竹;徐晗 | 申请(专利权)人: | 中国检验检疫科学研究院 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王朋飞 |
地址: | 100029 北京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 鉴定 金花 snp 分子 标记 及其 应用 | ||
1.用于鉴定金花茶的SNP分子标记,其特征在于,其位于如SEQ ID NO.1所示的金花茶GBSSI基因的第141位碱基,此处碱基为T,则鉴定为金花茶物种。
2.权利要求1所述SNP分子标记在金花茶分子标记辅助育种中的应用。
3.用于PCR检测金花茶的特异性引物对,其特征在于,包括上游引物F5’-CTGTGGACGCAAACATCCACTTGAT-3’和下游引物R5’-CCATGTATTTCTTGCCAGTGCCCT-3’。
4.一种鉴定金花茶的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)提取待测植物的基因组DNA;
2)以待测植物的基因组DNA为模板,利用权利要求3所述的特异性引物对PCR扩增金花茶GBSSI基因;
3)检测PCR扩增产物;
其中,金花茶GBSSI基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤3)中采用酶切法检测PCR扩增产物,酶切产物的琼脂糖凝胶电泳结果呈现2条带,则待测植物为金花茶物种;
其中,酶切使用的限制性内切酶为BstXI。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤2)中25μL PCR反应体系中包括:添加Mg2+的10×EX Taq缓冲液2.5μL,2.5mM dNTPs2μL,10μM上、下游引物各1μL,5U/μL EX Taq DNA聚合酶0.2μL,50μg/μL基因组DNA1μL,余量为ddH2O。
7.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤2)中PCR扩增程序为:94℃预变性5min;94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸50s,35个循环;72℃延伸10min,4℃保存。
8.含有权利要求3所述引物对的用于检测金花茶的试剂盒。
9.根据权利要求8所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括dNTPs、Taq DNA聚合酶、Mg2+、PCR反应缓冲液、标准阳性模板中的一种或多种。
10.权利要求3所述引物对或权利要求8或9所述试剂盒在检测金花茶中的应用。
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