[发明专利]双重分子信标-LAMP法同时检测金黄色葡萄球菌基因和大肠杆菌基因的试剂盒及方法有效
| 申请号: | 201310285642.6 | 申请日: | 2013-07-09 |
| 公开(公告)号: | CN103436602A | 公开(公告)日: | 2013-12-11 |
| 发明(设计)人: | 龚频;王兰;张涛涛;陈福欣 | 申请(专利权)人: | 陕西科技大学 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/14;C12Q1/10 |
| 代理公司: | 西安通大专利代理有限责任公司 61200 | 代理人: | 陆万寿 |
| 地址: | 710021 *** | 国省代码: | 陕西;61 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 双重 分子 信标 lamp 同时 检测 金黄色 葡萄球菌 基因 大肠杆菌 试剂盒 方法 | ||
1.双重分子信标-LAMP法同时检测金黄色葡萄球菌基因nuc和大肠杆菌O157:H7的rfbE基因的试剂盒,其特征在于,包括LAMP反应体系,所述LAMP反应体系中含有检测金黄色葡萄球菌基因nuc和大肠杆菌O157:H7的rfbE基因的引物组,该引物组包含nuc基因的一对外引物F3、B3,一对内引物FIP、BIP和一个分子信标探针;还包含rfbE基因的一对外引物F3、B3,一对内引物FIP、BIP和一个分子信标探针;
其中,所述的nuc基因的引物组为:
外引物F3的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.1所示;
外引物B3的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.2所示;
内引物FIP的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.3所示;
内引物BIP的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.4所示;
分子信标探针的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.5所示;
所述的rfbE基因的引物组为:
外引物F3的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.6所示;
外引物B3的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.7所示;
内引物FIP的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.8所示;
内引物BIP的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.9所示;
分子信标探针的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.10所示;
所述的LAMP反应体系的总体积为25μl,包括以下组分:
1)2μl的待测样品模板DNA;
2)nuc基因和rfbE基因的外引物F3、B3各0.4μM/L,内引物FIP、BIP各2.4μM/L,rfbE基因的外引物F3、B3各0.4μM/L,内引物FIP、BIP各2.4μM/L;
3)DNA聚合酶:每μl含8个活性单位的Bst DNA聚合酶;
4)2.8mmol/l的dNTP,0.8mol/l的甜菜碱,2μl的Buffer,2μl的ddH2O。
2.根据权利要求1所述的双重分子信标-LAMP法同时检测金黄色葡萄球菌基因nuc和大肠杆菌O157:H7的rfbE基因的试剂盒,其特征在于,所述的Nuc基因的分子信标探针的核苷酸序列的5’端连接有荧光染料Rox,3’端连接有荧光猝灭基团DABCYL。
3.根据权利要求1所述的双重分子信标-LAMP法同时检测金黄色葡萄球菌基因nuc和大肠杆菌O157:H7的rfbE基因的试剂盒,其特征在于,所述的rfbE基因的分子信标探针的核苷酸序列的5’端连接有荧光染料FAM,3’端连接有荧光猝灭基团DABCYL。
4.采用权利要求1所述的双重分子信标-LAMP法同时检测金黄色葡萄球菌基因nuc和大肠杆菌O157:H7的rfbE基因的试剂盒进行检测的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)采用LAMP反应体系,该体反应体系包括金黄色葡萄球菌基因nuc的引物和分子信标探针,大肠杆菌O157:H7的rfbE基因的引物和分子信标探针;
2)待测样品处理及模板提取
取待测细菌样品,用生理盐水悬浮后,离心,取沉淀,向沉淀中加入样品预处理液,混合均匀后,煮沸10min后,冷却10min,再次离心,取上清,得到待测样品的模板DNA;
3)LAMP等温扩增
将待测样品的模板DNA加入到LAMP反应体系中,在60~70℃下,反应50~70min;
4)显色检测
取LAMP等温扩增后的产物,加入显色液,与阳性对照,直接以肉眼观察变化。
5.根据权利要求4所述的双重分子信标-LAMP法同时检测金黄色葡萄球菌基因nuc和大肠杆菌O157:H7的rfbE基因的检测方法,其特征在于:步骤2)所述的样品预处理液是将40μl20mg/mL的溶菌酶,30μl10%的SDS,10μl20mg/mL的蛋白酶K和100μl5mol/L的NaCl,充分混匀后,在8000r/min下,离心10min后,得到的上清液。
6.根据权利要求5所述的双重分子信标-LAMP法同时检测金黄色葡萄球菌基因nuc和大肠杆菌O157:H7的rfbE基因的检测方法,其特征在于:所述的溶菌酶在使用前先在37℃下,保温30min;所述的蛋白酶K在使用前先在53℃下,保温30min。
7.根据权利要求4所述的双重分子信标-LAMP法同时检测金黄色葡萄球菌基因nuc和大肠杆菌O157:H7的rfbE基因的检测方法,其特征在于:步骤2)所述的离心是在8000~12000r/min下,离心1~3min。
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