[发明专利]一种检测尿液中PCA3基因和PSA基因表达量的荧光定量PCR法及其诊断试剂盒在审
申请号: | 201310182694.0 | 申请日: | 2013-05-17 |
公开(公告)号: | CN104164474A | 公开(公告)日: | 2014-11-26 |
发明(设计)人: | 刘代新;何胜祥 | 申请(专利权)人: | 刘代新 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 215101 江苏省苏州市吴中区木*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 尿液 pca3 基因 psa 表达 荧光 定量 pcr 及其 诊断 试剂盒 | ||
1.一种用于检测尿液样本中PCA3基因和PSA基因表达量的荧光定量PCR法,其特征在于:
为避免PCA3和PSA基因组DNA的干扰,首先跨内含子设计PCA3和PSA的特异性的引物和Taqman荧光探针,2个探针使用不同的荧光染料进行标记,可以在同一反应液中进行扩增和检测,同时加入内参检测引物和探针对样本处理和PCR扩增进行全程监控。然后利用含PCA3和PSA特异性扩增片段的体外转录RNA定量标准品制作标准曲线,对尿液样本中PCA3和PSA mRNA分别进行定量。最后通过对比PCA3基因和PSA基因表达量,建立PCA3评分标准,PCA3分数可以协助临床医生判断患者得前列腺癌的可能性,有效预测前列腺穿刺阳性活检率。
2.如权利1所述,PCA3 mRNA检测所用的引物和探针为:
上游引物PCA3-F序列为5′-GCTTCCTGTGTGTGTGGATATTTAA-3′;
下游引物PCA3-R序列为5′-GAGAAGCTGGCATCAGAAAAACA-3′;
荧光探针PCA3-P序列为5′-TCCTGGTCTCCCTCGGCTGCA-3′,5′端标记FAM荧光报告基团,3′端标记BHQ1荧光淬灭基团。
3.如权利1所述,PSA mRNA检测所用的引物和探针为:
上游引物PSA-F序列为:5′-GTCTGCGGCGGTGTTCTG-3′;
下游引物PSA-R序列为:5′-GCTGTGGCTGACCTGAAATACC-3′;
荧光探针PSA-P序列为:5′-CCCCAGTGGGTSCTCACAGCTGC-3′,5′端标记HEX荧光报告基团,3′端标记BHQ1荧光淬灭基团。
4.如权利1所述,内参基因检测所用的引物和探针为:
上游引物IC-F序列为:5′-TGAAGGCTCATGGCAAGAAAGT-3′;
下游引物IC-R序列为:5′-TTGTCACAGTGCAGCTCACTCA-3′;
荧光探针ICP序列为:5′-ACAACCTCAAGGGCACCTTTGCCAC-3′,5′端标记ROX荧光报告基团,3′端标记BHQ2荧光淬灭基团。
5.如权利1所述,PCA3标准品中含的特异性扩增片段为:
GAGAAGCTGGCATCAGAAAAACAGAGGGGAGATTTGTGTGGCTGCAGCCGAGGGAGACCAGGAAGATCTGCATGGTGGGAAGGACCTGATGATACAGAGGTGAGAAATAAGAAAGGCTGCTGACTTTACCATCTGAGGCCACACATCTGCTGAAATGGAGATAATTAACATCACTAGAAACAGCAAGATGACAATATAATGTCTAAGTAGTGACATGTTTTTGCACATTTCCAGCCCCTTTAAATATCCACACACACAGGAATC。
6.如权利1所述,PSA标准品中含的特异性扩增片段为:
GGGCAGTCTGCGGCGGTGTTCTGGTGCACCCCCAGTGGGTCCTCACAGCTGCCCACTGCATCAGGAACAAAAGCGTGATCTTGCTGGGTCGGCACAGCCTGTTTCATCCTGAAGACACAGGCCAGGTATTTCAGGTCAGCCACAGCTTCC。
7.一种PCA3和PSA mRNA核酸荧光定量PCR检测试剂盒,该试剂盒包括:PCA3/PSA-PCR反应液、PCA3/PSA RNA阳性对照、阴性对照、4种已知浓度的PCA3/PSA RNA定量标准品。
8.如权利7所述,PCA3/PSA-PCR反应液各成分的终浓度为:1X的反转录PCR缓冲液、4mM的MgCl2、0.4mM的dNTP、2U的Taq DNA聚合酶、2U的AMV逆转录酶、200nM的PCA3-F、200nM的PCA3-R、150nM的PCA3-P、200nM的PSA-F、200nM的PSA-R、200nM的PSA-P、100nM的IC-F、100nM的IC-R和100nM的IC-P。
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