[发明专利]一种多靶点基因检测甲型H1N1流感病毒变异株的方法和试剂盒无效
申请号: | 201310169249.0 | 申请日: | 2013-05-07 |
公开(公告)号: | CN103215387A | 公开(公告)日: | 2013-07-24 |
发明(设计)人: | 沈洁;厉力华;徐铭恩 | 申请(专利权)人: | 杭州电子科技大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
代理公司: | 浙江杭州金通专利事务所有限公司 33100 | 代理人: | 徐飞虎;徐关寿 |
地址: | 310018 浙江省杭州市*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 多靶点 基因 检测 h1n1 流感病毒 变异 方法 试剂盒 | ||
1.一种用于检测甲型H1N1流感病毒变异株的试剂盒,该试剂盒含有如下的多组引物:
一组针对M基因检测所有甲型流感病毒的引物,其序列如下所示:
1)5’-GAA TGG CTA AAG ACA AGA CC-3′(SEQ ID NO:1)
2)5’-GCT GCA GTC CTC GCT CAC T-3’(SEQ ID NO:2)
其中序列1)和2)分别为检测所有甲型流感病毒M基因的正义引物和反义引物,反义引物的5’端标记报告荧光基团FAM(6-carboxy-荧光素);
一组针对HA基因检测所有H1N1的流感的引物,其序列如下所示:
3)5’-GCA GAT CAA AAG AGC ACA CAA AAT-3′(SEQ ID NO:3)
4)5’-CCA AAG TTC TTT CAT TTT CCA AT-3’(SEQ ID NO:4)
其中序列3)和4)分别为检测所有H1N1流感病毒HA基因的正义引物和反义引物,反义引物的5’端标记报告荧光基团FAM(6-carboxy-荧光素);
一组针对HA基因检测甲型H1N1流感病毒2009变异株的引物序列,其序列如下所示:
5)5’-CAT TCG CAA TGG AAA GAA A-3′(SEQ ID NO:5)
6)5’-TCC TCA ATC CTG TGG CCA G-3’(SEQ ID NO:6)
其中序列5)和6)分别为检测甲型H1N1流感病毒(2009变异株)HA基因的正义引物和反义引物,反义引物的5’端标记报告荧光基团FAM(6-carboxy-荧光素);
一组针对人类beta-2-microglobulin基因检测样品中人体组织的引物序列,其序列如下所示:
7)5’-CCA GCA GAG AAT GGA AAG T-3′(SEQ ID NO:7)
8)5’-GAT GCT GCT TAC ATG TCT CG-3’(SEQ ID NO:8)
其中序列7)和8)分别为检测人类beta-2-microglobulin基因的正义引物和反义引物,反义引物的5’端标记报告荧光基团FAM(6-carboxy-荧光素)。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,该试剂盒含有如下的成分:
(1)、RT-PCR反应液,包括1-10×RT缓冲液、SEQ ID NO:1、SEQID NO:3、SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:7正义引物混合、RT-PCR酶和dNTP;
(2)、PCR反应液,包括1-10×PCR缓冲液、MgCl2、SEQ ID NO:1-8共8种引物混合、Taq DNA聚合酶和dNTP;
(3)、纯水;
(4)、阴性对照:流感病毒阴性样品RNA;
(5)、阳性对照:甲型H1N1流感病毒2009变异株阳性样品RNA。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中,RT-PCR反应液中RT缓冲液反应终浓度为1X;引物反应终浓度为0.05umol/L–0.5umol/L;RT-PCR酶反应终浓度为2U-10U(20ul/反应);dNTP反应终浓度为0.1mmol/L–0.6mmol/L。
4.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中,10×RT缓冲液组成为750mmol/L KCl、30mmol/L MgCl2、50mmol/L DTT、500mmol/L Tris-HCl(pH8.3,25℃)。
5.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中,RT-PCR反应液中PCR缓冲液反应终浓度为1X;MgCl2反应终浓度为1.0mmol/L-3.0mmol/L;引物反应终浓度为0.05umol/L–0.5umol/L;PCR酶反应终浓度为0.2U-5U(20ul/反应);dNTP反应终浓度为0.1mmol/L–0.6mmol/L。
6.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中,10×PCR缓冲液的组成为:500mmol/L KCl、100mmol/LTris-HCl(pH9.0,25℃)、1.0%Triton X-100。
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