[发明专利]基于DPO引物检测布氏杆菌的引物序列及其检测试剂盒有效

专利信息
申请号: 201310165560.8 申请日: 2013-05-08
公开(公告)号: CN103215372A 公开(公告)日: 2013-07-24
发明(设计)人: 徐义刚;李丹丹;张柏棋;刘忠梅;李苏龙 申请(专利权)人: 黑龙江出入境检验检疫局检验检疫技术中心
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11;C12N15/63;C12N15/66;C12R1/01
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 150001 黑龙江省*** 国省代码: 黑龙江;23
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摘要:
搜索关键词: 基于 dpo 引物 检测 杆菌 序列 及其 试剂盒
【说明书】:

技术领域

发明属于生物检测技术领域,具体涉及一种基于DPO引物检测布氏杆菌的引物序列及其检测试剂盒。 

背景技术

布氏杆菌属(Brucella)是一类革兰氏阴性短小杆菌,可感染多种家畜和野生动物,主要引起母畜传染性流产。同时也可感染人,特别是羊布氏杆菌对人的威胁最大,引起相似的临床症状和病理损伤,如睾丸炎或附睾炎、不育、生殖器官及胎膜发炎、流产、不孕、关节炎、气管炎及各种组织的局部病灶等,导致巨大的经济损失和严重的公共卫生问题。 

    现有的布氏杆菌检测方法: 细菌学检测,初步分离时,须在5%~10%二氧化碳环境中才能生长,且待检样本中必须存在大量活菌才能被分离出,细菌培养周期长,因此该检测方法已逐渐被淘汰。 血清学检测,凝集试验操作简便、检测时间短,但由于IgM在中性或弱酸性时凝集能力最活跃,所以凝集试验往往因抗体的交叉反应易出现假阳性结果,2000年OIE取消了凝集试验作为布氏杆菌病的诊断方法;沉淀试验由于人为进行结果观察,所以存在判定结果的主观性,有时会出现误判,也不是一种理想的检测方法;补体结合试验主要用以检测牛、羊和猪布氏杆菌病,操作中对温度和试剂滴加量要求高,也无法避免假阳性结果。 变态反应,主要用于山羊和绵羊检疫,但山羊的变态反应不如绵羊变态反应易判定结果,仅对中、后期病山羊的诊断意义较大,适于山羊布氏杆菌病的筛检,不作个体的诊断依据。 ELISA方法,竞争ELISA尚无诊断标准,间接ELISA是一种先进、快速、可靠的检测方法,但存在无法区别疫苗抗体与致病株抗体的不足。 PCR方法,是用于细菌DNA检测最可靠的方法。PCR技术作为一种高度灵敏、快速简便的检测方法在诸多领域得到了广泛应用,尤其在病原体检测方面取得了革命性的成果,成为核酸快速检测的金标准,并在此基础之上,又发展了DNA探针技术、实时荧光PCR技术和PCR结合变性高效液相色谱(DHPLC)技术等,而PCR引物的设计又成为了制约该类检测方法成败的关键性因素。常规的PCR引物设计,不仅需要反复比对引物的特异性,而且需要优化引物的各项参数与反应条件,尤其是退火温度,以防止非特异性扩增,特别是涉及多重PCR时,需要大量的实验以验证检测方法的特异性,费时又费力。 

双启动寡核苷酸引物(Dual priming oligonucleotide,DPO)的设计方法简化了建立常规PCR方法的操作步骤。该DPO引物的设计分为两部分,中间用多聚次黄嘌呤肌苷连接,5'-端长18-25bp,3'-端长6-15bp。由于该类引物特殊的结构,引物自身以及引物间难形成二级结构且对退火温度不敏感,试验过程中不需要对引物进行筛选以及对退火温度进行优化。同时,DPO引物与模板发生错配的几率小,因为只要有3个以上碱基发生错配,就不会成功扩增,比常规PCR引物的特异性更强,所以利用DPO引物建立的PCR方法,其检测结果比常规PCR方法更为精确。 

在此情况下,采用DPO引物建立DPO-PCR方法对布氏杆菌实施精准检测,对保障公共卫生安全具有重要意义。本发明根据布氏杆菌属(Brucella)Omp25靶基因的保守区设计合成了DPO鉴定引物,通过反应体系与反应条件的优化,建立了布氏杆菌DPO-PCR精准检测方法。本发明可用于临床病例的快速诊断和流行病学调查,具有一定的实用性。 

发明内容

基于以上不足之处,本发明的目的在于提供一种基于DPO引物检测布氏杆菌的引物序列及其检测试剂盒。 

本发明所采用的技术如下: 

一种基于DPO引物检测布氏杆菌的PCR方法检测用引物对, 

上游引物BO-DPOF:如序列表Seq No.1所示,

下游引物BO-DPOR:如序列表Seq No.2所示。

本发明还具有如下特征: 

1、一种基于DPO引物检测布氏杆菌的PCR方法制备阳性对照品的PCR扩增引物,

上游引物BO-F:如序列表Seq No.3所示,

下游引物BO-R:如序列表Seq No.4所示。

2、一种基于DPO引物检测布氏杆菌的PCR方法阳性对照品pMD-T-Omp25,如序列表Seq No.5所示。 

3、一种基于DPO引物检测布氏杆菌的PCR方法阳性对照品pMD-T-Omp25的制备方法,包括以下步骤: 

(1)、PCR模板的制备:布氏杆菌基因组DNA的提取和纯化;

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