[发明专利]一种高通量全基因组DNA甲基化检测技术无效
申请号: | 201310163085.0 | 申请日: | 2013-05-06 |
公开(公告)号: | CN103233072A | 公开(公告)日: | 2013-08-07 |
发明(设计)人: | 王师;吕佳;包振民;张玲玲;胡晓丽;陆维 | 申请(专利权)人: | 中国海洋大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 青岛海昊知识产权事务所有限公司 37201 | 代理人: | 曾庆国 |
地址: | 266003 *** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 通量 基因组 dna 甲基化 检测 技术 | ||
1.一种全基因组DNA甲基化检测方法,包括如下的步骤:
1)将基因组DNA用内切酶FspEI酶进行酶切,获得酶切片段;
2)将酶切片段的两端分别连接上接头,作为扩增引物的结合点;
3)将连接上接头的酶切片段用引物进行第一轮PCR扩增,从而富集接头连接正确的酶切片段;
4)将第一轮PCR扩增产物经凝胶纯化后用引物进行第二轮PCR扩增,引入Barcode来构建测序文库;
5)测序文库进行测序;将测序数据进行分析得到全基因组甲基化信息。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于所述的步骤2)中的接头,为接头slx1和slx2,其中构成slx1的两个核苷酸片段,其序列分别为SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2;
构成slx2的两个核苷酸片段,其序列分别为SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:2。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于所述的步骤3)中的引物的核苷酸序列分别为SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:5。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于所述的步骤4)中的引物的核苷酸序列分别为SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:6。
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