[发明专利]用于检测百合无症病毒的引物、试剂盒及检测方法有效
申请号: | 201310162813.6 | 申请日: | 2013-05-06 |
公开(公告)号: | CN103243175A | 公开(公告)日: | 2013-08-14 |
发明(设计)人: | 陈定虎;陈祖华;王宏 | 申请(专利权)人: | 陈定虎 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 中山市铭洋专利商标事务所(普通合伙) 44286 | 代理人: | 邹常友 |
地址: | 528400*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 百合 病毒 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种用于检测百合无症病毒的引物,其特征在于:
引物序列:
LSV Primer-1:5'-AAGATGAAAGTTGGCGTCGT-3',
LSV Primer-2:5'-CACAAGCATGCTGTTCCACA-3'。
2.一种检测百合无症病毒的试剂盒,其特征在于该试剂盒包括有:
其中所述的LSV Primer-1序列为5'-AAGATGAAAGTTGGCGTCGT-3';所述的LSV Primer-2序列为5'-CACAAGCATGCTGTTCCACA-3'。
3.根据权利要求2所述的一种检测百合无症病毒的试剂盒,其特征在于所述的Enzyme Mix包括反转录酶、PCR扩增用的Taq聚合酶、RNA酶抑制剂;所述的Buffer包括MgCl225mM、dNTPs10mM;所述Positive Control为百合无症病毒的核酸;所述RNase Free dH2O为除去RNA酶后的去离子水。
4.一种检测百合无症病毒的检测方法,其特征在于包括以下步骤:
A、待测样品RNA提取,得模板RNA溶液;
B、将步骤A中的模板RNA溶液反转录成cDNA,再采用引物LSVPrimer-1和LSV Primer-2对进行PCR扩增,得PCR反应液;其中所述的LSV Primer-1序列为5'-AAGATGAAAGTTGGCGTCGT-3';所述的LSV Primer-2序列为5'-CACAAGCATGCTGTTCCACA-3';
C、取PCR反应液进行琼脂糖凝胶电泳分析;
D、若存在297bp的DNA条带,则证明所检测用品中带有百合无症病毒。
5.根据权利要求4所述的一种检测百合无症病毒的检测方法,其特征在于步骤A中所述待测样品RNA提取,具体包括如下步骤:
a1、选取0.1-0.2g表现可疑症状的百合叶片组织,同时用等量健康组织作为对照;将百合叶片组织加液氮冷冻,充分研磨后装入1.5mL离心管中;
a2、在离心管中加入冰冷的400μL RNA抽提液,颠倒混合均匀;
a3、台式冷冻离心机4℃,12000g离心10min;
a4、取上清,加入400μL苯酚、氯仿、异戊醇的混合液,其中苯酚、氯仿、异戊醇的体积比为25:24:1,颠倒混合均匀;
a5、台式冷冻离心机4℃,12000g离心10min;
a6、取上清,加入400μL氯仿、异戊醇的混合液,其中氯仿、异戊醇的体积比为24:1,颠倒混合均匀;
a7、台式冷冻离心机4℃,12000g离心10min;
a8、取上清,加入1000μL无水乙醇和40μL3M醋酸钠pH5.2,颠倒混合均匀;
a9、台式冷冻离心机4℃12000g离心10min;
a10、留沉淀,用500μL70%冷乙醇洗涤一次,置于超净工作台上吹干,然后溶于20μL无RNA酶的水中。
6.根据权利要求4所述的一种检测百合无症病毒的检测方法,其特征在于步骤B中所述模板RNA溶液反转录成cDNA,具体包括以下步骤:
在0.5mL离心管中加入去离子水9.5μL,加入总RNA2μL,Primer-2引物1μL,浓度为10mmol/L的dNTPs1μL,70℃水浴5min后立即置于冰上2min;然后3000rpm离心30s;再加入5×cDNA第一链合成缓冲液4μL,0.1mol/L DTT1μL;RNase抑制剂1μL(30U);M-MLV反转录酶1μL(20U);37℃60min。
7.根据权利要求4所述的一种检测百合无症病毒的检测方法,其特征在于步骤B中所述PCR扩增具体包括以下步骤:
在0.2mL离心管中加入10×PCR扩增缓冲液2.5μL,浓度为25mmol/L的MgCl22μL,浓度为10mmol/L的dNTPs1μL,Primer-11μM(50pmol),Primer-21μM(50pmol),cDNA第一链合成反应液2μL,加水至25μL,然后加入Taq聚合酶0.5μL(1U);PCR循环条件:94℃变性3min;然后94℃1min,52℃1min,72℃1min,循环35次;最后72℃延伸10min;4℃保存反应产物。
8.根据权利要求4所述的一种检测百合无症病毒的检测方法,其特征在于步骤C中所述琼脂糖凝胶电泳分析具体包括以下步骤:
c1、用1×TAE缓冲液和琼脂糖按1.5%的浓度配好,在微波炉中熔化均匀,冷却至50-60℃;
c2、加入I核酸染料或浓度为1μg/mL的溴化乙锭,混合均匀,倒入凝胶平台上,插上样品梳;
c3、待凝胶凝固后,拔出梳子,加入适量的TAE缓冲;
c4、取1μL加样缓冲液与5μL PCR反应液混合均匀,然后分别将其和合适的DNA分子量标准物加入样品孔中;
c5、接通电源进行电泳,电压5V/cm;
c6、当加样缓冲液中的溴酚蓝迁移至足够分离DNA片段时,停止电泳;将整个胶置于凝胶成像系统中观察,并照像记录。
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