[发明专利]一种用于五种鳜亚科鱼类分子的试剂盒及鉴定方法有效
申请号: | 201310096677.5 | 申请日: | 2013-03-25 |
公开(公告)号: | CN104073547A | 公开(公告)日: | 2014-10-01 |
发明(设计)人: | 梁旭方;田昌绪;杨敏;郑荷子;赵程;窦亚琪;黄威 | 申请(专利权)人: | 华中农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 武汉宇晨专利事务所 42001 | 代理人: | 王敏锋 |
地址: | 430070 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 五种鳜亚科 鱼类 分子 试剂盒 鉴定 方法 | ||
1.一种用于五种鳜亚科鱼类分子的试剂盒,它包括三对SSR引物和标准图谱,其中用于聚合酶链式反应的三对引物序列分别为:
引物1正向序列:5’TACATGCACACCAGTACGG3’,
引物1反向序列:5’ACCCCGTTAAGTCCACGTC3’;
引物2正向序列:5’ TAAGTGTACAAAGAACTTTTCGC3’,
引物2反向序列:5’ ACAATGTAAAAGTTTGGTTCAGC3’;
引物3正向序列:5’ATCAGCTCAACCCCTCTGCA3’,
引物3反向序列:5’GCATGGATGCCAGCGTGA3’;
用于鉴别五种鳜亚科鱼类的标准图谱为:
一种引物1扩增的部分物种鳜亚科鱼类的微卫星带谱;一种引物2扩增的部分物种鳜亚科鱼类的微卫星带谱;一种引物3扩增的部分物种鳜亚科鱼类的微卫星带谱。
2.权利要求1所述的一种试剂盒用于五种鳜亚科鱼类的分子的鉴定方法,其步骤是:
1)DNA提取:采集待测鳜鱼样品的鳍条或者肌肉组织,提取基因组DNA并测定其纯度和浓度;测得DNA的A260/A280比值为1.82-1.97;
2)DNA片段扩增:采用聚合酶链式反应扩增待测样品基因组DNA,扩增引物序列为:
引物1正向序列:5’TACATGCACACCAGTACGG3’,
引物1反向序列:5’ACCCCGTTAAGTCCACGTC3’;
引物2正向序列:5’ TAAGTGTACAAAGAACTTTTCGC3’,
引物2反向序列:5’ ACAATGTAAAAGTTTGGTTCAGC3’;
引物3正向序列:5’ATCAGCTCAACCCCTCTGCA3’,
引物3反向序列:5’GCATGGATGCCAGCGTGA3’;
本步骤中测得DNA的浓度范围为585.5-3210.4 ng/μl;
PCR反应程序为:94℃预变性4min,然后按以下条件进行35个循环:94℃变性30s,55℃退火45s,72℃延伸1min,循环结束后72℃延伸10min结束,4℃中保存;
3)PCR产物的电泳及银染色鉴定:对PCR产物用非变性聚丙烯酰胺凝胶进行电泳分离,常规银染法染色后,拍照记录电泳结果;采用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶;
4)与标准图谱进行对比:使用引物1,样品在靠近标准Marker的300bp位置扩增出1条DNA条带,则鉴定为中国少鳞鳜;使用引物1,在靠近标准Marker的180bp位置扩增出1条特异性条带,鉴定为斑鳜;使用引物2,样品在靠近标准Marker的200bp位置扩增出1条或2条DNA条带,鉴定为波纹鳜;使用引物3,样品在靠近标准Marker的120bp位置扩增出1条DNA条带,鉴定为翘嘴鳜;使用引物3,样品在靠近标准Marker的120bp位置扩增出1条DNA条带,鉴定为大眼鳜。
3.根据权利要求2所述的一种试剂盒用于五种鳜亚科鱼类的分子的鉴定方法,其特征在于:所述的步骤(3)中PCR反应体系为:
根据权利要求2所述的一种试剂盒用于五种鳜亚科鱼类的分子的鉴定方法,其特征在于:所述的步骤(4)中使用引物1和引物2,待测样品为五种鳜亚科鱼类:翘嘴鳜、大眼鳜、斑鳜、中国少鳞鳜及波纹鳜中的任意一种。
4.根据权利要求2所述的一种试剂盒用于五种鳜亚科鱼类的分子的鉴定方法,其特征在于:所述的步骤(4)中使用引物3时,待测样品为翘嘴鳜或大眼鳜任意一种。
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